Les inhibiteurs chimiques de la peroxine 19 peuvent agir par divers mécanismes qui perturbent finalement le rôle de la protéine dans la biogenèse des peroxysomes, en affectant particulièrement son processus de lipidation et son association membranaire. La triacsine C, en ciblant l'acyl-CoA synthétase à longue chaîne, entraîne une pénurie d'acyl-CoA, qui sont essentiels à la lipidation de la peroxine 19. La cérulénine et le C75, tous deux inhibiteurs de l'acide gras synthase, réduisent la disponibilité des acides gras pour la production d'acyl-CoA, qui est une condition préalable à la modification lipidique fonctionnelle de la peroxine 19. De même, la perhexiline et l'étomoxir, qui inhibent la carnitine palmitoyltransférase 1, entraînent une réduction de l'oxydation des acides gras. Cela limite la production d'acyl-CoAs, entravant ainsi la lipidation nécessaire à la fonction de la peroxine 19. Le malonyl-CoA agit comme un substrat inhibiteur naturel de la CPT1 et peut atteindre des niveaux qui entraînent une diminution des réserves d'acyl-CoA, ce qui inhibe davantage le processus de lipidation essentiel au rôle de la peroxine 19.
En outre, le 2-bromopalmitate inhibe directement le métabolisme des acides gras, qui est crucial pour la synthèse des acyl-CoA et la lipidation ultérieure de la peroxine 19. La tunicamycine, bien qu'elle n'affecte pas directement la peroxine 19, induit un stress du RE qui peut avoir un effet en cascade sur le trafic des protéines cellulaires, entravant indirectement la fonction d'importation des protéines peroxysomales de la peroxine 19. La Brefeldine A perturbe le fonctionnement de l'appareil de Golgi et la Monensine modifie les gradients de pH lysosomal et de Golgi, deux processus qui peuvent indirectement affecter le transport et le fonctionnement de la Peroxine 19. La trifluopérazine, par son antagonisme de la calmoduline, peut interférer avec les voies de signalisation du calcium qui ont des effets en aval sur le rôle de la peroxine 19 dans la dynamique membranaire. Enfin, le WY-14643, en tant qu'agoniste PPAR alpha, peut modifier le métabolisme des lipides, entraînant des changements dans les espèces et les quantités de lipides qui sont nécessaires à la fonction optimale de la peroxine 19, inhibant ainsi indirectement l'activité de la protéine dans l'importation des protéines peroxysomales.
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