Les inhibiteurs énumérés ci-dessus ciblent principalement les processus en amont de la polyadénylation, tels que la transcription et le traitement de l'ARN, qui pourraient indirectement influencer l'activité de la PAP-α. Étant donné le rôle critique de la PAP-α dans la maturation de l'ARN, la modulation de ces processus en amont est importante pour comprendre sa fonction et sa régulation potentielle. La cordycépine et l'actinomycine D peuvent affecter directement la synthèse et le traitement de l'ARN, ce qui peut avoir un impact sur les substrats disponibles pour la PAP-α. L'α-amanitine, le DRB et les composés inhibant l'ARN polymérase II ou III diminueraient la synthèse des substrats de l'ARN pour la PAP-α.
Le flavopiridol et le triptolide, en inhibant les facteurs impliqués dans l'élongation et l'initiation de la transcription, pourraient indirectement affecter l'activité de la PAP-α. La leptomycine B et le Selinexor, en affectant l'exportation nucléaire, pourraient indirectement influencer la dynamique des substrats d'ARN traités par la PAP-α. Le CX-5461, en inhibant l'ARN polymérase I, pourrait influencer la synthèse de l'ARN ribosomal, affectant ainsi indirectement le rôle de la PAP-α dans le traitement de l'ARNm. Les inhibiteurs du spliceosome tels que la Meayamycine B et le Pladienolide B pourraient avoir un impact sur la maturation des substrats du pré-ARNm pour la PAP-α.
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