Os inibidores da NUDT22 abrangem uma variedade de compostos que actuam em diferentes fases do metabolismo das purinas e da síntese de nucleótidos. Estes inibidores não visam diretamente a NUDT22, mas diminuem a disponibilidade dos seus substratos ou aumentam a concentração de inibidores competitivos, o que pode resultar na inibição indireta da função da NUDT22. Por exemplo, o alopurinol e o metotrexato têm como alvo enzimas a montante da síntese de nucleótidos de purina, o que pode levar a níveis alterados de substratos necessários para a atividade da NUDT22. Especificamente, a inibição das vias de síntese de purinas pelo metotrexato pode diminuir significativamente os níveis de nucleótidos disponíveis para o NUDT22 processar.
Do mesmo modo, compostos como a mercaptopurina e o ácido micofenólico perturbam a síntese e o metabolismo dos nucleótidos de purina. Ao fazê-lo, não só reduzem a concentração de substratos para a NUDT22, como também podem aumentar a concentração de análogos de nucleótidos, que podem inibir competitivamente a função enzimática da NUDT22. A mercaptopurina actua como um antimetabolito que é incorporado no ADN e no ARN, levando à inibição da síntese de nucleótidos de purina. Uma vez que a NUDT22 está envolvida na manutenção dos pools de nucleótidos através da hidrólise de difosfatos de nucleósidos de purina oxidados, a presença de mercaptopurina pode levar à acumulação destes substratos, possivelmente inibindo a função da NUDT22 devido à sobrecarga de substrato ou à inibição competitiva.
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