Los inhibidores químicos de MYLK3 ejercen sus efectos inhibidores a través de varios mecanismos que se dirigen a vías de señalización y quinasas específicas que están interconectadas con el papel funcional de MYLK3. ML-7 y ML-9, por ejemplo, inhiben la cinasa de cadena ligera de miosina (MLCK), lo que resulta en una disminución de la fosforilación de las cadenas ligeras de miosina. Como MYLK3 también fosforila estas cadenas ligeras de miosina, la acción de ML-7 y ML-9 reduce indirectamente la disponibilidad del sustrato para MYLK3, inhibiendo así su actividad. De forma similar, la estaurosporina, un inhibidor de proteína cinasa de amplio espectro, suprime la proteína cinasa C (PKC), que comparte vías de señalización con MYLK3, especialmente en la regulación de la contracción muscular. Al inhibir la PKC, la estaurosporina disminuye indirectamente la capacidad de MYLK3 para fosforilar sus dianas descendentes.
Los inhibidores químicos como Wortmannin y LY294002 inhiben las fosfoinositide 3-kinasas (PI3K), interrumpiendo la señalización PI3K/AKT que es crucial para muchos procesos celulares, incluidos los que implican a MYLK3. Al obstruir esta vía, estos inhibidores contribuyen a la inhibición funcional de MYLK3. En una línea similar, H-89 y Gö 6976 se dirigen a la proteína quinasa A (PKA) y a las proteínas quinasas dependientes de calcio/calmodulina, respectivamente. La inhibición de estas quinasas por H-89 y Gö 6976 puede reducir la fosforilación de proteínas dentro de la misma vía que MYLK3, inhibiendo así indirectamente su actividad quinasa. Y-27632 y KN-93, al inhibir ROCK y CaMKII, respectivamente, afectan a la dinámica del citoesqueleto de actina y a las vías de señalización del calcio, ambas esenciales para el correcto funcionamiento de MYLK3. La inhibición de estas quinasas por Y-27632 y KN-93 conduce a una reducción de la actividad funcional de MYLK3, ya que está implicada en procesos relacionados. Además, U0126, PD 98059 y SB 203580 inhiben específicamente MEK1/2 y p38 MAP quinasa, respectivamente, que se encuentran aguas arriba de la señalización ERK. Dado que MYLK3 está implicada en la vía ERK, la inhibición de estas quinasas puede conducir a una disminución de la actividad quinasa de MYLK3.
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