MS4A3 può impegnare una serie di vie di segnalazione per potenziare la sua attività attraverso la fosforilazione. La forskolina stimola direttamente l'adenilil ciclasi, che catalizza la conversione dell'ATP in AMP ciclico (cAMP). L'aumento dei livelli di cAMP porta all'attivazione della protein chinasi A (PKA), un enzima responsabile della fosforilazione di una moltitudine di proteine cellulari, tra cui MS4A3. Analogamente, l'isoproterenolo, un agonista beta-adrenergico, e la terbutalina, insieme al salbutamolo, che sono agonisti dei recettori beta2-adrenergici, innescano la stessa cascata attraverso il recettore beta-adrenergico, culminando nell'attivazione della PKA che può colpire la MS4A3. Anche la dopamina e l'adenosina, che agiscono rispettivamente sui recettori D1-like e A2A, aumentano il cAMP all'interno della cellula, promuovendo ulteriormente l'attività della PKA e la conseguente fosforilazione di MS4A3.
Anche la prostaglandina E2 (PGE2) e l'istamina, attraverso l'interazione con i rispettivi recettori accoppiati a proteine G, contribuiscono all'aumento delle concentrazioni intracellulari di cAMP, portando a processi di fosforilazione mediati dalla PKA che attivano MS4A3. L'epinefrina, agendo sui recettori beta-adrenergici, segue un meccanismo simile, con conseguente attivazione della PKA. Gli inibitori della fosfodiesterasi IBMX e Rolipram aumentano il cAMP impedendone la degradazione, sostenendo così il segnale di attivazione della PKA, che a sua volta può fosforilare MS4A3. Inoltre, BAY 60-6583, attivando selettivamente il recettore dell'adenosina A2B, porta all'accumulo di cAMP e alla successiva attivazione della PKA, fornendo un'altra via per la fosforilazione e l'attivazione di MS4A3. Ciascuna di queste sostanze chimiche, attraverso le loro interazioni uniche con le vie di segnalazione cellulare, converge in ultima analisi sull'attivazione della PKA, che può quindi fosforilare e regolare l'attività di MS4A3.
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