ロイシンのようなアミノ酸は、単にタンパク質合成のための構成要素であるだけでなく、細胞成長とタンパク質翻訳の重要な調節因子であるmTORシグナル伝達経路を活性化する。この活性化は、リボソームタンパク質や、効果的なタンパク質合成に必要な他の要素の産生を増加させるよう、細胞にシグナルを送る。同様に、レスベラトロールやエピカテキンのような遺伝子調節作用で知られる化合物は、PGC-1αのようなミトコンドリアの生合成に関与する遺伝子の発現を特異的にアップレギュレートし、ミトコンドリアのリボソームタンパク質の増加をもたらす。コエンザイムQ10やα-リポ酸などの代謝中間体は、ミトコンドリアの健康維持に不可欠であり、オルガネラがタンパク質を合成するのに必要なエネルギーを確保する。コエンザイムQ10は電子伝達鎖に不可欠であり、α-リポ酸はミトコンドリア代謝における役割で知られ、どちらもタンパク質合成のエネルギー依存プロセスにとって極めて重要である。
ベザフィブラートやピオグリタゾンなどの他の化合物は、ミトコンドリア機能に関連する遺伝子の発現を調節することによってその効果を発揮する。ベザフィブラートはミトコンドリア遺伝子の発現を増加させ、タンパク質合成の亢進につながる可能性があり、一方、ピオグリタゾンはミトコンドリア遺伝子の発現とタンパク質合成に影響を与える核内受容体であるPPARγを活性化する。ウロリチンAやスペルミジンのようなオートファジー促進剤は、損傷したミトコンドリア成分の除去を促進することにより、ミトコンドリアの健全性に寄与し、ミトコンドリアリボソームのターンオーバーと更新をサポートする。この更新プロセスにより、リボソーム機構が機能的かつ効率的になり、MRP-L27のようなタンパク質がタンパク質合成に効果的に参加できるようになる。1,1-ジメチルビグアニド、塩酸塩およびニコチンアミドリボシドなどのNAD+前駆体は、それぞれAMPKを活性化し、NAD+レベルを増加させることにより、ミトコンドリアのリボソームタンパク質を間接的にサポートする。
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