O MRP-L21 funciona principalmente através da modulação das vias de sinalização celular que melhoram a biogénese mitocondrial e a funcionalidade do ribossoma mitocondrial. A forskolina estimula diretamente a adenilil ciclase, o que leva a um aumento dos níveis de AMP cíclico (AMPc) na célula, promovendo assim a ativação das vias dependentes de AMPc que estão envolvidas na síntese proteica mitocondrial. Do mesmo modo, o isoproterenol, ao ativar a adenilil ciclase através dos receptores beta-adrenérgicos, aumenta o AMPc intracelular, o que, por sua vez, pode aumentar a produção e a atividade das proteínas ribossómicas mitocondriais, incluindo a MRP-L21. O dibutiril-AMP, um análogo sintético do AMPc, contorna os receptores de superfície celular e ativa diretamente a proteína quinase A (PKA), conduzindo a efeitos a jusante que promovem a expressão genética mitocondrial e a atividade ribossómica. Outro composto, o Rolipram, inibe a fosfodiesterase-4, impedindo assim a degradação do AMPc e mantendo a sua ação no interior da célula, o que pode promover a função do MRP-L21. O zaprinast e o IBMX, ao inibirem a fosfodiesterase-5 e as fosfodiesterases não selectivas, respetivamente, elevam os níveis de AMPc e de GMPc, o que pode aumentar a atividade do ribossoma mitocondrial e do MRP-L21.
A anisomicina, embora seja principalmente um inibidor da síntese proteica, pode ativar as vias de resposta ao stress, como a p38 MAPK e a JNK, a baixas concentrações, o que pode afetar a atividade da proteína ribossómica mitocondrial. O AICAR, ao ativar a proteína quinase activada por AMP, pode estimular a biogénese mitocondrial e potencialmente reforçar o papel da MRP-L21 na síntese proteica no interior das mitocôndrias. O ácido retinóico afecta o metabolismo e a diferenciação celular, o que pode aumentar a procura de proteínas ribossómicas mitocondriais e, por conseguinte, ativar a MRP-L21. O resveratrol, através da ativação da SIRT1, pode promover a função mitocondrial e a necessidade de síntese proteica mitocondrial, o que, por sua vez, pode ativar a MRP-L21. A espermidina pode induzir a autofagia e a biogénese mitocondrial, aumentando assim potencialmente a atividade das proteínas ribossómicas mitocondriais, como a MRP-L21. Por último, a ativação de PGC-1α, por exemplo, pelo agonista PPARδ GW501516, regula a biogénese mitocondrial e pode, assim, aumentar a procura e a ativação de proteínas ribossómicas mitocondriais, incluindo a MRP-L21, para apoiar a síntese proteica mitocondrial.
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