Los inhibidores de la MCTP2 abarcan una amplia gama de compuestos químicos que actúan sobre los aspectos dependientes del calcio de las funciones de la MCTP2 en el tráfico de membranas. Por ejemplo, BAPTA-AM y Thapsigargin actúan para perturbar el equilibrio de calcio intracelular, que es crucial para la actividad de MCTP2; BAPTA-AM logra esto a través de la quelación selectiva de calcio, mientras que Thapsigargin interrumpe las reservas de calcio ER mediante la inhibición de la bomba SERCA. Del mismo modo, el 2-APB y la Xestospongina C actúan sobre la liberación de calcio mediada por el receptor IP3, y el SKF-96365 inhibe los canales de entrada de calcio mediados por el receptor, todos ellos cruciales para mantener la señalización de calcio de la que depende la MCTP2. Compuestos como el ML-9 y el U-73122 dificultan indirectamente la actividad de la MCTP2 por su acción sobre las cinasas y enzimas ascendentes, la MLCK y la fosfolipasa C, respectivamente, que intervienen en la regulación de la dinámica del citoesqueleto y la producción de mensajeros secundarios críticos para los procesos mediados por la MCTP2.
Otros efectos inhibidores sobre la MCTP2 se consiguen mediante la modulación del influjo y la liberación de calcio por compuestos como el Nifedipino, el TMB-8, la Ryanodina y el KN-93. El nifedipino, un bloqueante de los canales de calcio de tipo L, limita la afluencia de calcio, disminuyendo así indirectamente la actividad de la MCTP2. El TMB-8 y la Ryanodina interfieren con la liberación de calcio de los almacenes internos, actuando el TMB-8 como inhibidor y la Ryanodina causando el agotamiento al bloquear el receptor de rianodina en un estado abierto. Además, W-7 y KN-93 sirven como antagonistas de las proteínas que interactúan con el calcio para modular la función de MCTP2: W-7 inhibe los procesos dependientes de la calmodulina, y KN-93 se dirige a CaMKII, una cinasa que fosforila proteínas implicadas en las vías de señalización del calcio. En conjunto, estos inhibidores utilizan diferentes mecanismos moleculares para reducir la actividad funcional de MCTP2, lo que pone de relieve el papel integral del calcio en la regulación de las capacidades de tráfico de esta proteína.
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