MBD6 Inhibitoren

Gängige MBD6 Inhibitors sind unter underem 5-Azacytidine CAS 320-67-2, RG 108 CAS 48208-26-0, Procainamide hydrochloride CAS 614-39-1, Zebularine CAS 3690-10-6 und 5-Aza-2′-Deoxycytidine CAS 2353-33-5.

Chemische Inhibitoren von MBD6 zielen auf die Fähigkeit des Proteins ab, methylierte DNA zu erkennen und an sie zu binden - ein entscheidender Aspekt seiner Funktion bei der Genregulation. 5-Azacytidin und Decitabin sind Nukleosidanaloga, die nach dem Einbau in die DNA die DNA-Methyltransferasen (DNMTs) hemmen, Enzyme, die für das Anhängen von Methylgruppen an die DNA verantwortlich sind. Wird die Aktivität der DNMTs gehemmt, verändert sich die Methylierungslandschaft des Genoms, was zu einer Verringerung der methylierten Substrate führt, die MBD6 normalerweise bindet. In ähnlicher Weise hemmt RG108, ein nicht-nukleosidischer DNMT-Inhibitor, direkt die enzymatische Aktivität der DNMTs ohne Einbau in die DNA, was zu einer Hypomethylierung führt. Diese Verringerung der methylierten DNA-Stellen verringert die Fähigkeit von MBD6, sich mit seinen methylierten DNA-Zielen zu verbinden, und hemmt somit seine Funktion.

Darüber hinaus wirkt S-Adenosylhomocystein als Produktinhibitor für DNMTs, indem es die aktive Stelle des Enzyms besetzt und die Übertragung von Methylgruppen auf die DNA verhindert. Procainamid und Hydralazin haben beide bekannte Auswirkungen auf die DNA-Methylierung, obwohl ihre Mechanismen weniger gut definiert sind als die der Nukleosidanaloga. Zebularin, ein weiterer DNMT-Inhibitor, der in die DNA eingebaut wird, wirkt als DNMT-Falle, was zu einem passiven Verlust der DNA-Methylierung während der Replikation und einer verringerten MBD6-Aktivität führt. Polyphenole wie (-)-Epigallocatechin-3-gallat und Curcumin tragen ebenfalls zur Hemmung der DNA-Methylierung bei. Insbesondere Curcumin ist dafür bekannt, dass es direkt an DNMTs bindet und deren Funktion hemmt. Disulfiram, ein Medikament, das für seine Verwendung in der Alkoholvermeidungstherapie bekannt ist, hemmt DNMT und könnte somit die DNA-Methylierung verringern, auf die MBD6 zur Bindung angewiesen ist. Die Hemmung von NF-κB durch Parthenolid, einem Transkriptionsfaktor, der möglicherweise eine Rolle in Signalwegen spielt, an denen MBD6 beteiligt ist, könnte über eine veränderte Genexpression zu einer indirekten Verringerung der Aktivität von MBD6 führen. Schließlich kann die Hemmung der Tyrosinkinase-Aktivitäten durch Genistein den Phosphorylierungszustand von Proteinen stören, was indirekt die Aktivität von MBD6 beeinflussen könnte, wenn die Phosphorylierung die Interaktionspartner von MBD6 oder seinen eigenen Modifikationszustand beeinflusst. Jede dieser Chemikalien trägt über verschiedene Mechanismen zur funktionellen Hemmung von MBD6 bei, indem sie seine Interaktion mit methylierter DNA stört oder den zellulären Kontext verändert, in dem MBD6 wirkt.