正钒酸钠可抑制磷酸酶,从而在维持蛋白质磷酸化方面发挥重要作用,而磷酸酶通常会逆转这种修饰。染色质重塑是调节蛋白质活性的另一个途径。5-Azacytidine 和 Trichostatin A 可分别抑制 DNA 甲基转移酶和组蛋白去乙酰化酶,从而使染色质状态更加开放,导致基因的转录激活。cAMP 类似物二丁烯酰-cAMP 可绕过细胞受体,直接刺激蛋白激酶 A,导致各种信号级联中的蛋白质磷酸化和活化。
MG132 等化合物可抑制蛋白酶体,从而防止蛋白质降解,并有可能增加其在细胞中的浓度,从而维持蛋白稳态。同样,17-AAG 也会破坏 Hsp90 的功能,Hsp90 是一种参与蛋白质折叠和稳定的伴侣蛋白,可导致其客户蛋白被激活。信号转导途径受到 LY294002 和 U0126 等分子的复杂影响,它们分别是 PI3K 和 MEK 的抑制剂。这些抑制剂会导致信号传导途径下游的蛋白质被激活。SB203580 对 p38 MAPK 有特异性抑制作用,p38 MAPK 参与对应激刺激的反应,可影响受该途径调控的蛋白质的活化状态。钙信号传导是受化学激活剂影响的另一个关键途径。Thapsigargin 通过抑制 SERCA 泵破坏钙储存,导致细胞膜钙增加,从而激活一系列钙依赖蛋白。Tunicamycin 是一种 N 联糖基化抑制剂,在蛋白质折叠和稳定性方面发挥作用,可对蛋白质的活化状态产生深远影响。
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