LY294002やPD98059のような化学物質は、それぞれPI3K経路やMEK経路の主要な酵素を標的とする。これらの経路は、細胞の増殖、分化、生存の制御に重要であり、それらの調節は、これらのシグナル伝達カスケードの下流または上流にあるタンパク質活性の変化をもたらす。同様に、SP600125とU0126は、JNKとMEK1/2経路を破壊する手段を提供し、ストレスに対する細胞応答に影響を与え、細胞周期制御に影響を与える。
SB203580やPP2のような化合物は、p38 MAPKやSrcファミリーキナーゼのような酵素に注目し、炎症、ストレス応答、細胞移動のようなプロセスにおいて重要な役割を果たす。これらのキナーゼを阻害することにより、化学物質は、これらのシグナル伝達分子の活性化や抑制に依存するタンパク質の挙動を変化させることができる。ボルテゾミブとMG132はプロテアソーム阻害剤であり、その作用により、通常は分解されるはずのタンパク質が蓄積される可能性がある。その結果、細胞内のタンパク質レベルや機能が変化する可能性がある。タプシガルギンは、SERCAポンプを阻害することにより、多くのシグナル伝達経路において重要な二次メッセンジャーであるカルシウムのホメオスタシスを破壊する。2-DGとツニカマイシンはそれぞれ、解糖とタンパク質のグリコシル化といった基本的な細胞機能を阻害する。これらの阻害剤は、潜在的にLOC342293を含む多くのタンパク質の安定性と機能に有害な細胞環境を作り出す可能性がある。
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