IFIX阻害剤は、主にIFIXの転写制御に重要なNF-κB経路を標的とすることにより、間接的にIFIXの機能的活性を阻害する様々な化学化合物を包含する。ピロリジンジチオカルバミン酸と4-メチル-N1-(3-フェニルプロピル)ベンゼン-1,2-ジアミンは、どちらもNF-κBの核内移行を阻害する阻害剤であり、IFIXを含む遺伝子の活性化を妨げる。同様に、SN50は、ペプチドベースのメカニズムで、NF-κBの核局在化配列を阻害し、IFIXの発現を減少させる。IκBαのリン酸化を阻害するIKK-2 Inhibitor IVとBAY 11-7082は、いずれもNF-κB経路の上流で作用し、間接的にIFIXの転写活性を阻害する。NF-κBのDNA結合を阻害するパルテノライドと、IκBαの分解とNF-κBの活性化を阻害するプロテアソーム阻害剤であるMG-132は、遺伝子発現の減少によりIFIX活性を低下させる。キナクリンとスルフォラファンもまた、それぞれNF-κBのDNA結合と活性化を標的とし、転写誘導を制限することによってIFIXの機能的活性を低下させる。
これらの阻害剤に加えて、アンドログラフォリドとセラストロールは、ともにNF-κBシグナル伝達の構成要素に作用する。アンドログラフォリドはp50サブユニットを共有結合で修飾し、セラストロールはIκBキナーゼの分解を促進し、それぞれがIFIX発現の減少につながる。よく知られた緑茶ポリフェノールであるエピガロカテキンガレートも同様に、IκBαの分解を阻害し、NF-κBの活性化を抑制し、続いてIFIXの活性を低下させる。総合すると、これらのIFIX阻害剤は、NF-κB経路を利用して、転写レベルでの発現を減少させることにより、間接的にIFIXの機能的活性を抑制し、NF-κBシグナル伝達とIFIXの制御との間の重要な相互作用を明らかにしている。
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