A família HMG inclui proteínas que desempenham papéis em processos relacionados com o ADN, como a reparação, a replicação, a recombinação e a transcrição, normalmente afectando a estrutura da cromatina e a acessibilidade do ADN. Dentro da família HMG, sabe-se que proteínas como as da subfamília HMGB se ligam ao ADN de forma não específica e podem induzir alterações estruturais para facilitar várias funções celulares. Se a HMG-B3 fosse um membro recentemente caracterizado desta família de proteínas, os activadores desta proteína seriam moléculas concebidas para modular a sua atividade de ligação protéica ao ADN, influenciando os processos biológicos em que a proteína está envolvida. O desenvolvimento de tais activadores exigiria um conhecimento pormenorizado da estrutura e das interações da proteína, utilizando técnicas como a cristalografia de raios X ou a ressonância magnética nuclear (RMN) para determinar a estrutura tridimensional da proteína em complexo com o ADN ou outros parceiros de interação, o que informaria a conceção de moléculas que pudessem aumentar a sua atividade. O processo de identificação e otimização dos activadores da HMG-B3 envolveria provavelmente a seleção de bibliotecas químicas de alto rendimento para descobrir moléculas que possam aumentar a função da proteína, seguida de ensaios secundários para confirmar o aumento da atividade. Os compostos activados identificados através destes rastreios seriam então sujeitos a técnicas de química medicinal para melhorar a sua especificidade, potência e capacidade geral de ativar a proteína. Os químicos sintetizariam análogos destes compostos iniciais, alterando sistematicamente as suas estruturas e avaliando o impacto destas modificações na interação com a proteína. Vários métodos analíticos, incluindo ensaios biofísicos, seriam utilizados para elucidar a natureza da interação entre os potenciais activados e a HMG-B3, com o objetivo de compreender o mecanismo pelo qual aumentam a atividade da proteína. O objetivo final seria gerar uma coleção de activadores específicos e eficazes que pudessem ser utilizados para investigar o papel biológico da HMG-B3 e elucidar a sua função nos processos celulares.
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