GK2の化学的阻害剤には、GK2の機能的活性に重要な様々なシグナル伝達経路やキナーゼを標的とする様々な化合物が含まれる。強力なキナーゼ阻害剤であるスタウロスポリンは、GK2のATP結合部位を阻害し、キナーゼ活性を阻害することができる。この普遍的なキナーゼ阻害のメカニズムにより、GK2の酵素作用が直接阻害されることになる。同様に、ビシンドリルマレイミドIは、プロテインキナーゼC(PKC)を阻害することによって、GK2の活性化を低下させることができる。PKCは多くの場合、複数の下流タンパク質をリン酸化するため、その阻害はGK2の活性を効果的に低下させる。もう一つの化学物質であるSP600125は、c-Jun N-末端キナーゼ(JNK)を選択的に阻害し、シグナル伝達経路におけるGK2の役割に不可欠と思われる転写因子のリン酸化とその結果としての活性化を抑えることができる。
経路特異的阻害というテーマを続けると、LY294002とWortmanninはPI3K阻害剤であり、GK2を含むと思われる下流タンパク質のリン酸化を減少させることができる。GK2の機能的阻害は、PI3K阻害によるAktシグナル伝達の減少から生じる可能性がある。U0126とPD98059は、MEK1/2を阻害することによってMAPK/ERK経路を標的とし、GK2の機能に必要なリン酸化シグナル伝達を減少させる可能性がある。SB203580によるp38 MAPキナーゼの阻害もまた、GK2を障害する可能性がある。さらに、Srcファミリーキナーゼ阻害剤であるPP2は、GK2の活性化を低下させる。ラパマイシンのmTOR阻害もまた、タンパク質合成とキナーゼ活性を低下させ、間接的にGK2の機能に影響を及ぼす可能性がある。最後に、スニチニブとチェレリスリンは、それぞれ受容体チロシンキナーゼとPKCを標的とすることで、GK2を調節したり直接活性化したりするシグナル伝達カスケードを破壊し、細胞内での機能阻害につながる可能性がある。
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