Los inhibidores de FLJ45513, como la estaurosporina, son conocidos inhibidores de la cinasa que pueden alterar el estado de fosforilación de las proteínas, una modificación que es crítica para la función proteica. Del mismo modo, el U0126 y el SB431542 pueden inhibir la señalización MEK1/2 y TGF-β, respectivamente, vías que están íntimamente relacionadas con el control de la expresión génica y la actividad de las proteínas. Compuestos como SP600125 y LY333531 se dirigen a la vía JNK y a la proteína cinasa C β, respectivamente, ambas implicadas en la regulación de factores de transcripción y otras proteínas. La PP2, al inhibir las quinasas de la familia Src, y la PD173074, al dirigirse al FGFR, pueden afectar a múltiples proteínas corriente abajo a través de complejas redes de señalización.
Además, Y-27632 y ZM447439 pueden influir en el citoesqueleto y la progresión del ciclo celular, respectivamente, alterando así potencialmente la función y localización de las proteínas. La dorsomorfina y la XAV939, así como la IWP-2, se dirigen a las vías de señalización BMP y Wnt/β-catenina, que son cruciales para la diferenciación celular, el crecimiento y el desarrollo. Estas vías están conectadas a la regulación de numerosas proteínas, y su inhibición puede tener amplios efectos en la función de proteínas.
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