Si ritiene che le proteine della famiglia FAM90A si localizzino generalmente nel nucleo, il che implica un potenziale coinvolgimento in processi nucleari come il rimodellamento della cromatina, la regolazione dell'espressione genica e il mantenimento dell'integrità del genoma. Data la sua localizzazione nucleare putativa, FAM90A3 potrebbe interagire con altre proteine nucleari per modulare l'attività trascrizionale, influenzare la struttura della cromatina o svolgere un ruolo nel ciclo cellulare e nei meccanismi di riparazione del DNA.
La funzione di FAM90A3 può anche estendersi alla regolazione di processi cellulari fondamentali per lo sviluppo, il differenziamento o l'apoptosi. Attraverso potenziali interazioni proteina-proteina, FAM90A3 potrebbe influenzare varie vie di segnalazione e reti trascrizionali. Potrebbe servire come co-fattore per i fattori di trascrizione o come parte di un complesso multi-proteico che regola i modelli di espressione genica essenziali per le normali funzioni cellulari e le risposte agli stimoli esterni. Il profilo di espressione di FAM90A3 in diversi tessuti o in varie condizioni fisiologiche può offrire indizi sulla sua funzione. Il profilo di espressione di FAM90A3 in diversi tessuti o in varie condizioni fisiologiche può offrire indizi sulla sua funzione.
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