Die als ELP3-Inhibitoren bekannte chemische Klasse bezieht sich auf eine theoretische Gruppe von Verbindungen, die die Aktivität des ELP3-Proteins modulieren können. Direkte Inhibitoren für ELP3 sind nicht charakterisiert. Verbindungen, die die Funktion des Proteins beeinflussen, tun dies über indirekte Mechanismen, die eine Veränderung der epigenetischen Landschaft beinhalten. Als Teil des Elongator-Komplexes spielt ELP3 durch seine Acetylierungs- und Methylierungsaktivitäten eine Rolle bei der Regulierung der Transkription. Daher können Chemikalien, die die für diese Modifikationen verantwortlichen Enzyme hemmen, indirekt die Funktion von ELP3 beeinflussen.
Histon-Deacetylase-Inhibitoren wie Trichostatin A, SAHA und Entinostat können den Acetylierungszustand von Histonen und Nicht-Histon-Proteinen verändern, was sich auf das zelluläre Umfeld auswirken würde, in dem ELP3 arbeitet. Indem sie die Histon-Acetylierung erhöhen, können diese Verbindungen indirekt die Aktivität von ELP3 modulieren, das in ähnliche Prozesse involviert ist. In ähnlicher Weise können Histon-Acetyltransferase-Inhibitoren wie Anacardinsäure und Garcinol das Acetylierungsniveau senken, was sich auf die funktionelle Leistung von ELP3 auswirkt. Präparate wie C646, die auf spezifische Acetyltransferasen wie p300 abzielen, können auch indirekt auf die Wege wirken, an denen ELP3 beteiligt ist. An der Methylierungsfront können Inhibitoren von DNA-Methyltransferasen und Histon-Methyltransferasen wie 5-Azacytidin, RG108 und DZNep die Methylierungslandschaft von DNA bzw. Histonen verändern. Durch die Veränderung dieser epigenetischen Markierungen kann die Rolle von ELP3 bei der Transkriptionsregulierung und dem Chromatinumbau beeinflusst werden. Sinefungin, ein Methyltransferase-Inhibitor, und BIX-01294, ein spezifischer Inhibitor der G9a-Histon-Methyltransferase, können das Zusammenspiel von ELP3 mit Methylierungsprozessen in ähnlicher Weise modulieren.
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