Gli inibitori dell'EBFP sono una classe di composti chimici progettati per modulare l'attività dell'EBFP (Enhanced Blue Fluorescent Protein), una variante geneticamente modificata della proteina fluorescente verde (GFP) naturale di Aequorea victoria. La EBFP è ampiamente utilizzata in biologia molecolare e bioingegneria come marcatore fluorescente grazie alla sua capacità di emettere luce blu quando viene eccitata da specifiche lunghezze d'onda. Questa proprietà lo rende prezioso per tracciare e visualizzare vari processi biologici in cellule, tessuti e organismi vivi. La fluorescenza dell'EBFP è dovuta al suo unico cromoforo, una specifica sequenza di aminoacidi all'interno della proteina che assorbe ed emette luce. Gli inibitori della EBFP sono composti che interferiscono con questa attività fluorescente alterando la struttura del cromoforo o l'ambiente che lo circonda all'interno della proteina. L'inibizione della fluorescenza della EBFP può avvenire attraverso vari meccanismi. Alcuni inibitori possono legarsi direttamente al cromoforo e spegnere la sua fluorescenza alterando le sue proprietà elettroniche, impedendo così l'assorbimento e l'emissione di luce. Altri possono interagire con la struttura complessiva della proteina, inducendo cambiamenti conformazionali che interrompono la formazione del cromoforo o influenzano la sua capacità di fluorescenza. Inoltre, alcuni inibitori potrebbero agire promuovendo il photobleaching, un processo in cui il cromoforo perde la sua capacità di emettere luce nel tempo a causa dell'esposizione prolungata alla luce di eccitazione. Gli inibitori dell'EBFP sono strumenti preziosi nella ricerca per controllare e studiare le dinamiche della fluorescenza nei sistemi biologici. Modulando l'attività di EBFP, i ricercatori possono comprendere meglio i meccanismi che regolano la fluorescenza delle proteine ed esplorare l'uso della fluorescenza in un'ampia gamma di applicazioni biologiche e biochimiche.
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Nome del prodotto | CAS # | Codice del prodotto | Quantità | Prezzo | CITAZIONI | Valutazione |
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Actinomycin D | 50-76-0 | sc-200906 sc-200906A sc-200906B sc-200906C sc-200906D | 5 mg 25 mg 100 mg 1 g 10 g | $73.00 $238.00 $717.00 $2522.00 $21420.00 | 53 | |
L'actinomicina D si intercala nel DNA, in particolare nelle regioni ricche di GC, il che potrebbe portare al blocco trascrizionale del gene EBFP, diminuendone in ultima analisi l'espressione. | ||||||
Rifampicin | 13292-46-1 | sc-200910 sc-200910A sc-200910B sc-200910C | 1 g 5 g 100 g 250 g | $95.00 $322.00 $663.00 $1438.00 | 6 | |
Nei sistemi batterici, la Rifampicina si lega alla subunità beta dell'RNA polimerasi, che potrebbe direttamente downregolare la trascrizione di un gene EBFP sotto promotori batterici. | ||||||
α-Amanitin | 23109-05-9 | sc-202440 sc-202440A | 1 mg 5 mg | $260.00 $1029.00 | 26 | |
L'α-Amanitina si lega selettivamente all'RNA polimerasi II e la inibisce, determinando così una sostanziale diminuzione della sintesi di mRNA di EBFP nelle cellule eucariotiche. | ||||||
Triptolide | 38748-32-2 | sc-200122 sc-200122A | 1 mg 5 mg | $88.00 $200.00 | 13 | |
Il triptolide può modificare covalentemente le subunità del macchinario trascrizionale, portando potenzialmente a una forte riduzione della trascrizione del gene EBFP. | ||||||
DRB | 53-85-0 | sc-200581 sc-200581A sc-200581B sc-200581C | 10 mg 50 mg 100 mg 250 mg | $42.00 $185.00 $310.00 $650.00 | 6 | |
DRB inibisce selettivamente la fosforilazione della RNA polimerasi II, necessaria per l'allungamento trascrizionale, portando potenzialmente a una riduzione dei livelli di mRNA di EBFP. | ||||||
Cordycepin | 73-03-0 | sc-203902 | 10 mg | $99.00 | 5 | |
La cordycepina, un analogo dell'adenosina, potrebbe terminare prematuramente la trascrizione di EBFP, con conseguente diminuzione dell'mRNA di EBFP a lunghezza piena e, di conseguenza, dei livelli di proteina. | ||||||
Trichostatin A | 58880-19-6 | sc-3511 sc-3511A sc-3511B sc-3511C sc-3511D | 1 mg 5 mg 10 mg 25 mg 50 mg | $149.00 $470.00 $620.00 $1199.00 $2090.00 | 33 | |
Inibendo le istone deacetilasi, la tricostatina A potrebbe indurre un'iperacetilazione degli istoni, portando a un cambiamento conformazionale nella cromatina che riduce l'accessibilità del gene EBFP. | ||||||
Leptomycin B | 87081-35-4 | sc-358688 sc-358688A sc-358688B | 50 µg 500 µg 2.5 mg | $105.00 $408.00 $1224.00 | 35 | |
La leptomicina B si lega all'exportina 1, necessaria per l'esportazione nucleare dell'mRNA, che potrebbe inibire l'accumulo citoplasmatico dell'mRNA di EBFP, riducendo così la sintesi della proteina EBFP. | ||||||
Anisomycin | 22862-76-6 | sc-3524 sc-3524A | 5 mg 50 mg | $97.00 $254.00 | 36 | |
L'anisomicina interrompe la formazione di legami peptidici sui ribosomi, il che potrebbe inibire la traduzione di EBFP, con conseguente diminuzione della produzione di proteina EBFP. | ||||||
Cycloheximide | 66-81-9 | sc-3508B sc-3508 sc-3508A | 100 mg 1 g 5 g | $40.00 $82.00 $256.00 | 127 | |
La cicloeximide si lega al sito E dei ribosomi, inibendo il fattore di allungamento eucariotico eEF2, che potrebbe portare a un'inibizione della sintesi proteica di EBFP. |