Les inhibiteurs chimiques de la CCDC72 peuvent réguler son activité par divers mécanismes cellulaires. La trichostatine A, un inhibiteur connu de l'histone désacétylase, peut modifier les schémas d'expression des gènes en augmentant les histones acétylées. Cette augmentation peut affecter la transcription des gènes, y compris ceux liés à CCDC72, entraînant des changements dans l'activité de la protéine. De même, la staurosporine, un inhibiteur de protéine kinase à large spectre, peut inhiber l'activité des kinases responsables de la phosphorylation de CCDC72, affectant ainsi sa fonction. Le LY294002 et la Wortmannine, deux inhibiteurs spécifiques des phosphoinositides 3-kinases (PI3K), peuvent perturber la fonction de CCDC72 en entravant la voie de signalisation PI3K, qui est essentielle pour une multitude de processus cellulaires, y compris ceux impliquant CCDC72.
Le PD98059 et l'U0126, deux inhibiteurs de la protéine kinase activée par les mitogènes (MEK), peuvent diminuer l'activation de la voie MAPK/ERK, réduisant ainsi potentiellement l'activité de CCDC72, ce qui affecte encore plus la fonction de CCDC72. Le SB203580, un inhibiteur de la MAP kinase p38, peut entraver l'activité du CCDC72 s'il est associé à la voie de réponse au stress de la MAPK p38. La rapamycine, un inhibiteur de la cible mammalienne de la rapamycine (mTOR), peut supprimer les processus qui régulent la fonction de CCDC72, y compris la croissance et la prolifération cellulaires. SP600125, un inhibiteur de la c-Jun N-terminal kinase (JNK), peut diminuer l'activité de CCDC72 si la protéine est modulée par la signalisation JNK. Le ZM-447439, un inhibiteur de l'Aurora kinase, peut interférer avec la régulation du cycle cellulaire impliquant CCDC72. Enfin, le bortézomib et le MG132, deux inhibiteurs du protéasome, peuvent réguler CCDC72 en empêchant la dégradation protéasomique des protéines qui contrôlent son activité, ce qui entraîne des altérations de la fonction de la protéine.
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