Os inibidores do CCDC27 são um conjunto diversificado de compostos químicos que suprimem indiretamente a atividade funcional do CCDC27 através de várias vias de sinalização e processos celulares. Acredita-se que a rapamicina, um inibidor da mTOR, regula negativamente as vias envolvidas no crescimento e proliferação celular, diminuindo potencialmente a atividade do CCDC27 se este fizer parte desta via. Da mesma forma, a esturosporina tem como alvo geral as cinases que podem regular o CCDC27 através da fosforilação, pelo que a utilização deste inibidor pode levar a uma função reduzida do CCDC27. O LY 294002 e a Wortmannin, ambos inibidores da PI3K, podem suprimir a sinalização PI3K/Akt; se o CCDC27 funcionar nesta via, a sua atividade será reduzida. O SB 203580 e o U0126, que visam a p38 MAP quinase e a MEK1/2, respetivamente, podem reduzir o papel do CCDC27 na resposta ao stress ou na diferenciação celular, se estiver ligado à via MAPK/ERK. Além disso, o PD 98059 e o SP600125, que inibem a MEK e a JNK, poderiam atenuar a atividade do CCDC27 ao interferir com as respectivas cascatas de sinalização.
Os restantes compostos do grupo de inibidores do CCDC27 funcionam através de mecanismos diversos para impedir a atividade do CCDC27. A 6-ciano-7-nitroquinoxalina-2,3-diona, um antagonista dos receptores AMPA, pode reduzir o potencial envolvimento da CCDC27 nas vias de sinalização neural através da inibição da neurotransmissão excitatória. A brefeldina A interrompe o tráfico de vesículas, o que impediria a CCDC27 se esta desempenhasse um papel na formação ou no movimento das vesículas. A inibição da sinalização ouriço pela ciclopamina poderia reduzir a função do CCDC27 nos processos de diferenciação celular. Por último, a mitomicina C, um reticulador de ADN, poderia resultar numa diminuição da atividade da CCDC27 ao perturbar a progressão do ciclo celular. Coletivamente, estes inibidores poderiam servir para reduzir a atividade funcional da CCDC27, visando as vias ou processos específicos em que a proteína está envolvida, levando a uma inibição abrangente do seu papel celular.
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