A estauroporina é um inibidor proeminente da cinase, exercendo influência sobre um espetro de proteínas cinases que podem ter efeitos reguladores subsequentes na atividade do C9orf43. Ao inibir essas cinases, a estauroesporina modula indiretamente várias cascatas de sinalização nas células, que, por sua vez, podem afetar a funcionalidade ou a regulação da C9orf43. Do mesmo modo, o LY294002 e a Wortmannin, ambos inibidores da fosfoinositídeo 3-quinases (PI3K), perturbam as vias de sinalização celular críticas, impedindo a fosforilação de substratos PI3K, alterando assim potencialmente o contexto celular em que o C9orf43 funciona. No domínio da via da proteína quinase activada por mitogénio (MAPK), o U0126 e o PD98059, ambos inibidores da MEK, intervêm na cascata de quinase que é fundamental para a divisão e diferenciação celular, o que poderia cruzar-se com as vias biológicas que envolvem o C9orf43. A rapamicina, um inibidor da mTOR, acrescenta outra camada de complexidade ao influenciar o crescimento celular e o metabolismo, processos que são essenciais para o funcionamento correto de numerosas proteínas, possivelmente incluindo a C9orf43.
O SB203580, um inibidor da p38 MAP quinase, tem como alvo específico as vias de sinalização inflamatórias, que podem ter implicações de longo alcance nas funções das proteínas em toda a célula, incluindo as associadas ao C9orf43. A via da c-Jun N-terminal quinase (JNK), implicada na resposta celular ao stress, é visada pelo SP600125, um inibidor da JNK, proporcionando um meio de alterar potencialmente o ambiente celular do C9orf43. Para além das vias de sinalização, os moduladores epigenéticos, como a tricostatina A, um inibidor da histona desacetilase, e a 5-azacitidina, um inibidor da DNA metiltransferase, podem ter um impacto generalizado nos perfis de expressão genética, o que pode incluir a modulação da expressão do C9orf43. A brefeldina A, ao perturbar o aparelho de Golgi, pode influenciar indiretamente as proteínas envolvidas no tráfico e no processamento, incluindo a C9orf43. A tapsigargina, através da sua inibição da bomba SERCA, perturba a homeostase do cálcio, um aspeto fundamental da biologia celular com potenciais ramificações para uma multiplicidade de proteínas e processos celulares em que o C9orf43 pode estar implicado.
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