Los inhibidores como la estaurosporina y el U0126 actúan impidiendo la actividad de las quinasas, que son cruciales para la fosforilación y activación de muchas proteínas implicadas en las vías de señalización. Compuestos como el LY294002 y la wortmannina se dirigen a quinasas específicas dentro de la vía PI3K/AKT/mTOR, un conducto central para las señales que regulan el crecimiento, la proliferación y la supervivencia celular. Estos inhibidores pueden modular la actividad de proteínas reguladas por eventos de fosforilación y desfosforilación.
Asimismo, la rapamicina y sus análogos inhiben la vía mTOR, que está profundamente integrada con la síntesis proteica y la autofagia, afectando a una amplia gama de funciones celulares. La brefeldina A y la cicloheximida, por su parte, alteran procesos celulares fundamentales como el transporte y la síntesis de proteínas, respectivamente, afectando así a la función proteica a gran escala. Compuestos como la 2-Deoxi-D-glucosa interfieren en vías de producción de energía como la glucólisis, lo que podría afectar a proteínas que requieren ATP para su actividad. La MG132 inhibe el sistema ubiquitina-proteasoma, lo que conduce a la acumulación de proteínas que normalmente son objeto de degradación, afectando potencialmente al recambio y la función de las proteínas.
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