Gli inibitori che mirano all'attività funzionale di C11orf47 comprendono una serie di composti che agiscono su varie vie cellulari e molecolari. Questi inibitori sono selezionati in base al presupposto che C11orf47 sia coinvolto o influenzato da queste vie. LY294002 e Wortmannin, ad esempio, inibiscono la via PI3K/AKT, una cascata di segnalazione critica che regola la sopravvivenza e la proliferazione cellulare. Se C11orf47 è un substrato di AKT, l'inibizione di PI3K comporterebbe una riduzione della fosforilazione e della conseguente attività di C11orf47, poiché PI3K è a monte di AKT.
Analogamente, composti come PD98059, U0126, SP600125 e SB203580 mirano alla cascata di segnalazione MAPK in punti diversi. PD98059 e U0126 inibiscono MEK, che è a monte di ERK1/2, mentre SP600125 e SB203580 inibiscono specificamente JNK e p38 MAPK, rispettivamente. Se C11orf47 è un effettore a valle di una o più di queste MAPK, la sua attività diminuirebbe in presenza di questi inibitori a causa della riduzione dei segnali di fosforilazione. L'inibizione della segnalazione di mTOR da parte della rapamicina, che svolge un ruolo centrale nella crescita e nel metabolismo cellulare, potrebbe ridurre in modo analogo l'attività di C11orf47 se fa parte della rete di segnalazione di mTOR.
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