C11orf47の機能的活性を標的とする阻害剤には、様々な細胞経路や分子経路に作用する様々な化合物が含まれる。これらの阻害剤は、C11orf47がこれらの経路に関与している、あるいは影響を受けているという仮定に基づいて選択される。例えば、LY294002とWortmanninは、細胞の生存と増殖を制御する重要なシグナル伝達カスケードであるPI3K/AKT経路を阻害する。もしC11orf47がAKTの基質であれば、PI3KはAKTの上流にあるため、PI3Kの阻害はC11orf47のリン酸化とその後の活性の低下をもたらすであろう。
同様に、PD98059、U0126、SP600125、SB203580のような化合物は、異なるポイントでMAPKシグナル伝達カスケードを標的とする。PD98059とU0126はERK1/2の上流にあるMEKを阻害し、SP600125とSB203580はそれぞれJNKとp38 MAPKを特異的に阻害する。もしC11orf47がこれらのMAPKの一つ以上の下流エフェクターであれば、これらの阻害剤の存在下では、リン酸化シグナルが減少するため、その活性は低下すると考えられる。ラパマイシンによるmTORシグナル伝達の阻害は、細胞の成長と代謝において中心的な役割を果たすが、もしC11orf47がmTORシグナル伝達ネットワークの一部であれば、同様にC11orf47の活性を低下させる可能性がある。
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