Ag2阻害剤には、Ag2の機能を制御あるいは影響するシグナル伝達経路や酵素活性を標的とすることで、Ag2の機能的活性を間接的に抑制する様々な化合物が含まれる。阻害剤は、受容体チロシンキナーゼから細胞応答を伝播する主要な細胞内キナーゼまで、細胞シグナル伝達カスケードの異なるレベルで機能する。例えば、AG-490によるJAK2の阻害は、Ag2の制御に必須と思われるJAK/STATシグナル伝達経路を破壊する。この破壊は、Ag2の発現または活性に重要であると考えられるSTAT下流の遺伝子の転写活性化を減少させる。このように、Ag-490はAg2の制御機構を阻害することにより、間接的にAg2の活性を抑制することができる。
同様に、LY294002やWortmanninのような阻害剤は、細胞の生存、成長、増殖に重要な経路であるPI3K/ACTシグナル伝達経路を標的とする。AKTリン酸化とそれに続くシグナル伝達は、多くの細胞タンパク質の機能調節に重要であるため、Ag2がこれらの過程に関与するタンパク質または因子であれば、PI3Kの阻害によって影響を受ける可能性が高い。
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