Aftiphilinの機能的活性は、主にシナプス小胞の動態と神経細胞伝達の領域で発揮される。例えば、フォルスコリンは、細胞内のcAMPレベルを上昇させることにより、アフチフィリンを含む基質をリン酸化することが知られているプロテインキナーゼA(PKA)を活性化し、小胞輸送を促進することにより、間接的にアフチフィリンの役割を促進する。同様に、8-Bromo-cAMPやDibutyryl-cAMPのような化合物は、cAMPのアナログとして細胞膜を透過してPKAを活性化し、アフチフィリンやその相互作用パートナーのリン酸化につながり、シナプス小胞エンドサイトーシスにおけるその機能を増強すると考えられる。カリクリンAやオカダ酸のようなホスファターゼ阻害剤は、細胞タンパク質のリン酸化状態を増加させ、その中にはアフチフィリンに関連するものも含まれ、その活性を増強する可能性がある。さらに、PMAはPKC活性化剤として、アフチフィリン経路のタンパク質のリン酸化を引き起こし、膜融合と輸送におけるアフチフィリンの役割を間接的に高める可能性がある。
細胞内カルシウム濃度の調節は、アフチフィリンの活性化において極めて重要な役割を果たしており、イオノマイシンはカルシウム濃度を上昇させ、小胞融合過程におけるアフチフィリンの関与に影響を与える可能性がある。同様に、ベイK8644はL型カルシウムチャネルを刺激することにより、カルシウムを介したシグナル伝達事象を増幅し、アフチフィリンの機能を増強する可能性がある。イオンチャネルを調節するポリアミン・スペルミンもまた、アフチフィリンを活性化するシグナル伝達経路に影響を及ぼす可能性がある。キナーゼ調節の領域では、エピガロカテキンガレート(EGCG)が様々なプロテインキナーゼを阻害するため、神経細胞のシグナル伝達経路のバランスが変化し、アフチフィリンの活性に有利に働く可能性がある。アニソマイシンは、主にタンパク質合成阻害剤であるが、ストレス活性化プロテインキナーゼ(SAPK)を活性化し、アフチフィリンが関与する経路を介してシグナル伝達を行い、ニューロンにおけるストレス反応に関連する活性を高める可能性がある。最後に、塩化リチウムによるGSK-3の阻害は、神経伝達物質放出におけるアフチフィリンの機能的役割を間接的に高める可能性もある。これらを総合すると、これらの活性化因子は細胞内シグナル伝達経路に微妙で特異的な作用を及ぼし、シナプス小胞動態におけるアフチフィリンの役割を促進する。
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