繊毛および鞭毛関連タンパク質46の化学的活性化剤は、様々なシグナル伝達経路に関与し、その機能的活性化を開始することができる。例えば、フォルスコリンはアデニル酸シクラーゼを直接刺激し、細胞内のcAMPレベルを上昇させる能力で知られている。このcAMPの上昇はプロテインキナーゼA(PKA)の活性化につながり、PKAは繊毛および鞭毛関連タンパク質46をリン酸化し、その活性を高める。同様に、IBMXは、cAMPを分解するホスホジエステラーゼを阻害することで、細胞内のcAMPレベルを維持し、繊毛・鞭毛関連タンパク質46をリン酸化するPKAの活性化を間接的にサポートする。もう一つの活性化因子であるフォルボール12-ミリスチン酸13-アセテート(PMA)は、プロテインキナーゼC(PKC)を標的とする。PKCは、膨大な数のタンパク質をリン酸化することで知られるキナーゼである。活性化されると、PKCは繊毛と鞭毛に関連するタンパク質46を標的とし、直接リン酸化することで活性化につながる可能性がある。
これらに加えて、イオノマイシンとA23187は、細胞内カルシウム濃度を上昇させることによってその効果を発揮し、様々なカルシウム依存性キナーゼを活性化する。これらのキナーゼは、繊毛および鞭毛関連タンパク質46をリン酸化し、活性化する可能性がある。タプシガルギンはSERCAポンプを阻害することによって作用し、同様の細胞内カルシウムの上昇をもたらし、カルシウム応答性エレメントを介して繊毛および鞭毛関連タンパク質46の活性化を引き起こす可能性がある。オカダ酸やカリクリンAのようなホスファターゼ阻害剤は、タンパク質の脱リン酸化を防ぐので、繊毛と鞭毛関連タンパク質46はリン酸化され、活性化された状態に維持される。アニソマイシンはストレス活性化プロテインキナーゼを活性化し、このキナーゼは繊毛および鞭毛関連タンパク質46をリン酸化の標的とし、その結果活性化すると考えられる。一方、オレオイルエタノールアミドはPPAR受容体を活性化し、このタンパク質をリン酸化し活性化するキナーゼを刺激するかもしれない。最後に、スフィンゴシン-1-リン酸は、Gタンパク質共役型レセプターを介して、リン酸化イベントを通して繊毛・鞭毛関連タンパク質46の潜在的な活性化因子である下流のキナーゼを活性化することができる。
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