UGP2 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-408778

Übersicht

UGP2 kodiert die UDP-Glukose-Pyrophosphorylase 2, ein zytosolisches Enzym, das die reversible Bildung von UDP-Glukose aus Glukose-1-phosphat und UTP katalysiert und damit ein zentrales aktiviertes Zuckernukleotid für Biosyntheseprozesse bereitstellt. UDP-Glukose unterstützt den Glykogenstoffwechsel und trägt zu Glykosylierungswegen bei, indem sie Vorstufen für die Bildung von Glykokonjugaten und Glykolipiden liefert und dadurch den Proteintransport sowie Zell-Zell-Interaktionen beeinflusst. Über ihre Rolle im Kohlenhydratfluss und in der Glyk-Homöostase wird UGP2 häufig im Kontext metabolischer Umprogrammierung, der ER-/Golgi-Prozessierung und der Stressanpassung untersucht. Eine veränderte Verfügbarkeit von UDP-Glukose und veränderte Glykosylierungsmuster sind breit relevant für Mechanismen, die an metabolischen und proliferativen Erkrankungen beteiligt sind, was funktionelle Studien zu UGP2 in humanen Zellen motiviert.

Das UGP2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des UGP2-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des UGP2-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von UGP2 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die UGP2-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von UGP2-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der UGP2-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf UGP2-Exone abzielen, die für die UGP2-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere UGP2-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom UGP2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom UGP2 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des UGP2-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das UGP2 HDR-Plasmid (h) und UGP2 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von UGP2-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten UGP2-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.