TTF-1/Thyroid Transcription Factor 1/NKX2-1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m): sc-423405

概要

Nkx2-1は、ホメオドメインをもつ転写因子TTF-1（甲状腺転写因子1）をコードしており、甲状腺、肺上皮、ならびに腹側前脳の一部領域における系譜指定および分化プログラムを統括します。NKX2-1は、上皮としてのアイデンティティ、形態形成、分泌機能に関わる遺伝子ネットワークを制御しており、サーファクタント産生や甲状腺ホルモン生合成を制御する経路も含まれます。エンハンサーへの結合や他の発生制御因子との協調的相互作用を介して、組織特異的な転写状態とクロマチンアクセシビリティの維持に寄与します。NKX2-1の活性または発現の破綻は発生異常と関連し、甲状腺・肺疾患の生物学に加えて、系譜に関連した腫瘍形成や細胞運命転換の文脈でも頻繁に研究されています。

TTF-1/Thyroid Transcription Factor 1/NKX2-1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）は、mouse細胞株におけるNkx2-1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、Nkx2-1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、Nkx2-1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、TTF-1/Thyroid Transcription Factor 1/NKX2-1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、TTF-1/Thyroid Transcription Factor 1/NKX2-1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、Nkx2-1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• TTF-1/Thyroid Transcription Factor 1/NKX2-1の機能に不可欠なNkx2-1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、Nkx2-1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• TTF-1/Thyroid Transcription Factor 1/NKX2-1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）およびTTF-1/Thyroid Transcription Factor 1/NKX2-1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m2）によってコードされるgRNAは、Nkx2-1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  TTF-1/Thyroid Transcription Factor 1/NKX2-1 HDRプラスミド（m）および TTF-1/Thyroid Transcription Factor 1/NKX2-1 HDRプラスミド（m2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはNkx2-1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のNkx2-1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。