Plasmide CRISPR/Cas9 KO TP53INP2 (h): sc-405261

Présentation

TP53INP2 (tumor protein p53 inducible nuclear protein 2), également connu sous le nom de DOR, est un cofacteur sensible au stress impliqué dans la coordination de l’autophagie et des programmes transcriptionnels. Il participe à la biogenèse et au trafic des autophagosomes via des interactions avec des protéines ATG et des membres de la famille LC3, reliant la détection des nutriments au renouvellement lysosomal et au contrôle qualité cellulaire. TP53INP2 a également été associé à la régulation de l’expression génique dépendante des récepteurs nucléaires et aux réponses adaptatives au stress oxydatif et métabolique. Une activité dérégulée de TP53INP2 a été reliée à des modifications du flux autophagique et de l’homéostasie cellulaire, des processus fréquemment étudiés en biologie du cancer, dans les modèles de neurodégénérescence et de maladies métaboliques.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO TP53INP2 (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène TP53INP2 dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du TP53INP2, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert TP53INP2 à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine TP53INP2.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en TP53INP2 pour l'étude de la signalisation de TP53INP2, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de TP53INP2 essentiels à la fonction de TP53INP2
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de TP53INP2 pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le TP53INP2 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le TP53INP2 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus TP53INP2. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le TP53INP2 plasmide HDR (h) et le TP53INP2 (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie TP53INP2 pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles TP53INP2 définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.