SYND3/SDC3/Syndecan-3 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m): sc-423236

Übersicht

Sdc3 kodiert Syndecan‑3 (SYND3/SDC3), ein transmembranäres Heparansulfat‑Proteoglykan, das Signale der extrazellulären Matrix und Wachstumsfaktorgradienten an der Zelloberfläche organisiert. Durch die Bindung heparansulfatabhängiger Liganden moduliert SDC3 die Signalübertragung von Rezeptor‑Tyrosinkinasen und Chemokinen und beeinflusst dadurch die Umgestaltung des Zytoskeletts, Zellmigration, Neuritenauswachsung und synaptische Plastizität. In der Maus ist Sdc3 vor allem in neuronalen und metabolischen Geweben ausgeprägt und trägt zu Signalwegen bei, die Axonleitung, Zell‑Matrix‑Adhäsion und entzündliche Signalgebung steuern. Eine fehlregulierte Syndecan‑3‑Funktion wurde mit neuroentwicklungsbezogenen und neuroinflammatorischen Prozessen sowie mit Phänotypen eines veränderten Energiehaushalts in Verbindung gebracht, was seinen Einsatz als mechanistischer Knotenpunkt in der ZNS‑ und Stoffwechselforschung unterstützt.

Das SYND3/SDC3/Syndecan-3 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des Sdc3-Gens in mouse-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des Sdc3-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von Sdc3 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die SYND3/SDC3/Syndecan-3-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von Sdc3-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der SYND3/SDC3/Syndecan-3-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf Sdc3-Exone abzielen, die für die SYND3/SDC3/Syndecan-3-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere Sdc3-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom SYND3/SDC3/Syndecan-3 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m) und vom SYND3/SDC3/Syndecan-3 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (m2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des Sdc3-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das SYND3/SDC3/Syndecan-3 HDR-Plasmid (m) und SYND3/SDC3/Syndecan-3 HDR-Plasmid (m2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von Sdc3-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten Sdc3-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.