SAMD4A Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-406449

Panoramica

SAMD4A (sterile alpha motif domain containing 4A) è una proteina regolatoria legante l’RNA implicata nel controllo post-trascrizionale dell’espressione genica attraverso il riconoscimento di specifici motivi negli mRNA bersaglio. Partecipa alla stabilità e alla localizzazione degli mRNA, nonché alla repressione della traduzione, collegando l’attività di SAMD4A a transizioni dello stato cellulare e a programmi di adattamento allo stress che rimodellano il proteoma. Attraverso queste funzioni, SAMD4A può influenzare i percorsi che regolano proliferazione, differenziamento e output di segnalazione legati al sistema immunitario modulando la traduzione dei componenti di tali vie. Alterazioni nella regolazione di SAMD4A sono state esplorate nel contesto di programmi di espressione genica associati al cancro e di fenotipi infiammatori, in cui un metabolismo dell’RNA deregolato contribuisce a comportamenti cellulari rilevanti per la malattia.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO SAMD4A (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene SAMD4A in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del SAMD4A insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto SAMD4A a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina SAMD4A.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di SAMD4A per lo studio della segnalazione di SAMD4A, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni SAMD4A critici per la funzione di SAMD4A
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di SAMD4A per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal SAMD4A CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal SAMD4A CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus SAMD4A. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal SAMD4A Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR SAMD4A (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia SAMD4A per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio SAMD4A definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.