Pax-9 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-403899

Übersicht

PAX9 kodiert den Paired-Box-Transkriptionsfaktor Pax-9, einen nukleären, DNA-bindenden Regulator, der für die embryonale Musterbildung und die Organogenese essenziell ist. Pax-9 koordiniert Transkriptionsprogramme, die die kraniofaziale und pharyngeale Entwicklung, die Odontogenese sowie epithelial–mesenchymale Interaktionen steuern, und wirkt dabei innerhalb breiterer Entwicklungs-Gen-Netzwerke, zu denen PAX-Familienfaktoren und Homeobox-Signalwege gehören. In der Humangenetik ist eine veränderte PAX9-Funktion stark mit angeborener Zahnagenesie und damit verbundenen kraniofazialen Anomalien assoziiert, wodurch PAX9 ein zentraler Lokus für die Untersuchung der transkriptionellen Kontrolle in der Entwicklung ist. In zellulären Modellen stellt Pax-9 einen gut untersuchbaren Knotenpunkt dar, um Linienspezifizierung, morphogen-abhängige Genregulation und nachgeschaltete Differenzierungskaskaden zu analysieren.

Das Pax-9 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des PAX9-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des PAX9-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von PAX9 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die Pax-9-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von PAX9-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der Pax-9-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf PAX9-Exone abzielen, die für die Pax-9-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere PAX9-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom Pax-9 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom Pax-9 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des PAX9-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das Pax-9 HDR-Plasmid (h) und Pax-9 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von PAX9-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten PAX9-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.