NYNRIN Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-410066

Descripción general

NYNRIN codifica una gran proteína multidominio que, según se ha descrito, contiene regiones tipo NYN y tipo integrasa retroviral, lo que sugiere vínculos con interacciones con ácidos nucleicos o con complejos proteicos, aunque su función molecular exacta en células humanas sigue sin estar completamente caracterizada. Estudios transcriptómicos han asociado la expresión de NYNRIN con programas de desarrollo y diferenciación y con la regulación de la homeostasis celular en tejidos específicos. Se han observado alteraciones en la expresión de NYNRIN en múltiples contextos de enfermedad, lo que respalda su uso como factor candidato para investigar redes de expresión génica desreguladas. Al tratarse de un gen relativamente poco estudiado, NYNRIN se explora a menudo para definir la conectividad de vías, las transiciones de estado celular y los fenotipos que surgen tras la perturbación de reguladores con escasa anotación.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO NYNRIN (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen NYNRIN en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del NYNRIN junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de NYNRIN tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína NYNRIN.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en NYNRIN para la investigación de la señalización de NYNRIN, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de NYNRIN críticos para la función de NYNRIN
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de NYNRIN para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido NYNRIN CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido NYNRIN CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus NYNRIN. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR NYNRIN (h) y el plásmido HDR NYNRIN (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología NYNRIN para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana NYNRIN definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.