NOD1 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (m): sc-430738

Descripción general

El gen **Nod1** de ratón codifica **NOD1**, un receptor tipo NOD citosólico que detecta motivos específicos de peptidoglicano que contienen **ácido diaminopimélico** procedentes de bacterias **gramnegativas** e inicia la señalización de la inmunidad innata. Tras el reconocimiento del ligando, NOD1 recluta **RIPK2** para activar las vías **NF-κB** y **MAPK**, promoviendo la expresión de genes inflamatorios, respuestas antimicrobianas y la comunicación cruzada con la autofagia y los programas de barrera epitelial. La actividad de NOD1 modula las interacciones huésped–microbioma e influye en la producción de citocinas, por lo que es relevante en modelos experimentales de inflamación mucosa, biología de la infección y lesión tisular mediada por el sistema inmune. La señalización desregulada de NOD1 se ha implicado en la fisiopatología inflamatoria y la inflamación metabólica, lo que respalda su uso como un nodo genético para investigar los circuitos de la inmunidad innata.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO NOD1 (m) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen Nod1 en líneas celulares mouse. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del Nod1 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de Nod1 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína NOD1.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en Nod1 para la investigación de la señalización de NOD1, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de Nod1 críticos para la función de NOD1
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de Nod1 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido NOD1 CRISPR/Cas9 KO (m) y el plásmido NOD1 CRISPR/Cas9 KO (m2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus Nod1. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR NOD1 (m) y el plásmido HDR NOD1 (m2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología Nod1 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana Nod1 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.