NOD1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m): sc-430738

概要

マウス Nod1 は、グラム陰性菌由来のジアミノピメリン酸（DAP）を含む特定のペプチドグリカンモチーフを検知し、自然免疫シグナル伝達を開始する細胞質内NOD様受容体であるNOD1をコードする。リガンド認識後、NOD1はRIPK2をリクルートしてNF-κBおよびMAPK経路を活性化し、炎症関連遺伝子発現、抗菌応答、ならびにオートファジーや上皮バリア機構とのクロストークを促進する。NOD1活性は宿主–マイクロバイオーム相互作用を形作り、サイトカイン産生にも影響するため、粘膜炎症、感染生物学、免疫駆動性の組織傷害に関する実験モデルにおいて重要である。NOD1シグナルの制御異常は炎症性病態生理や代謝性炎症に関与すると示唆されており、自然免疫回路を解析するための遺伝学的ノードとしての利用を支持する。

NOD1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）は、mouse細胞株におけるNod1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、Nod1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、Nod1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、NOD1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、NOD1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、Nod1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• NOD1の機能に不可欠なNod1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、Nod1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• NOD1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）およびNOD1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m2）によってコードされるgRNAは、Nod1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  NOD1 HDRプラスミド（m）および NOD1 HDRプラスミド（m2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはNod1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のNod1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。