Niban CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-405758

Übersicht

FAM129A kodiert Niban, ein stressreaktives zytoplasmatisches Protein, das an der Regulation des Zellüberlebens und der Anpassung an ungünstige Bedingungen wie oxidativen Stress und Stress des endoplasmatischen Retikulums beteiligt ist. Niban wird mit der Modulation von Apoptose- und autophagieassoziierten Signalwegen in Verbindung gebracht und häufig im Kontext der PI3K/AKT- und MAPK-Signalweg-Outputs untersucht, die Proliferation und Stresstoleranz prägen. Eine veränderte FAM129A-Expression wurde bei mehreren Krebsarten beschrieben und dient als molekularer Readout der Fitness von Tumorzellen und ihrer Stressanpassung. Diese Eigenschaften machen Niban zu einem nützlichen Ziel, um Signalnetzwerke zu analysieren, die zelluläre Stressantworten mit der Wachstumskontrolle koppeln.

Das Niban CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des FAM129A-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des FAM129A-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von FAM129A nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die Niban-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von FAM129A-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der Niban-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf FAM129A-Exone abzielen, die für die Niban-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere FAM129A-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom Niban CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom Niban CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des FAM129A-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das Niban HDR-Plasmid (h) und Niban HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von FAM129A-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten FAM129A-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.