matrin-3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-418085

概要

MATR3は、核マトリックスのRNA/DNA結合タンパク質であるマトリン3をコードしており、核ラミナやクロマチンと結合して核構造およびゲノム構成の維持に寄与します。マトリン3は、pre-mRNAスプライシング、mRNAの安定化、リボヌクレオタンパク質複合体との相互作用を介した遺伝子発現調節など、RNAプロセシングに関与します。さらに、その機能は核—細胞質間の構造・輸送制御、DNA損傷応答、ストレス顆粒の動態を司る経路とも交差しており、MATR3は神経細胞におけるプロテオスタシスおよびRNA恒常性と関連づけられています。MATR3の異常な制御や変異は、ALS/FTDスペクトラム障害を含む神経変性表現型と関連していることが報告されており、RNA結合タンパク質の機能不全や核構造異常の研究において重要な標的です。

matrin-3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるMATR3遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、MATR3内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、MATR3のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、matrin-3タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、matrin-3シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、MATR3欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• matrin-3の機能に不可欠なMATR3エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、MATR3ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• matrin-3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびmatrin-3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、MATR3遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  matrin-3 HDRプラスミド（h）および matrin-3 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはMATR3ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のMATR3標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。