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matrin-3 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-418085-ACT | 20 µg | $397.00 |
MATR3 は matrin-3 をコードしており、matrin-3 は核マトリックスに局在する RNA/DNA 結合タンパク質で、核内構造の維持に寄与するとともに、クロマチンやリボ核タンパク質複合体との相互作用を介して遺伝子発現を協調的に制御します。Matrin-3 は RNA スプライシング、mRNA の安定化、核内保持に関与し、転写産物のプロセシングやストレス応答性の遺伝子プログラムの調節と結び付いています。その機能ネットワークは RNA 代謝および核—細胞質の構造・輸送に関わる経路と交差しており、これらのプロセスは神経変性疾患でしばしば破綻します。MATR3 の機能異常や病的バリアントは運動ニューロン病および関連する神経筋表現型と関連づけられており、RNA 結合タンパク質の生物学を研究するための機構的ハブとして有用であることを示しています。
matrin-3 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性MATR3の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
matrin-3 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における MATR3 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はMATR3転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性matrin-3の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のMATR3遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるmatrin-3依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびMATR3発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるmatrin-3経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。