LOC147645 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-406583

Übersicht

VSIG10L (LOC147645) kodiert ein vorhergesagtes Protein mit V-Set- und Immunglobulin-Domänen, das voraussichtlich an der Zelloberfläche lokalisiert ist und an Zell-Zell- bzw. Zell-Matrix-Interaktionen beteiligt ist. Aufgrund seiner Domänenarchitektur und der Homologie zu anderen Mitgliedern der Immunglobulin-Superfamilie wird VSIG10L mit epithelialen Adhäsionsprogrammen und der Regulation der Gewebearchitektur in Verbindung gebracht – Prozesse, die sich mit Differenzierung, Barrierefunktion und migra­tionsbezogenen Signalnetzwerken überschneiden. Unterschiede in der Expression verwandter Ig-Domänen-Proteine sind häufig mit veränderten Interaktionen im Tumormikromilieu und metastatischen Eigenschaften verknüpft, weshalb VSIG10L ein potenzielles Ziel für mechanistische Studien in der Krebsbiologie und im epithelialen Remodeling darstellt. Die funktionelle Untersuchung von LOC147645 kann daher Aufschluss über Signalwege geben, die adhäsionsabhängige Signalübertragung und phänotypische Plastizität von Zellen steuern.

Das LOC147645 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des VSIG10L-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des VSIG10L-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von VSIG10L nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die LOC147645-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von VSIG10L-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der LOC147645-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf VSIG10L-Exone abzielen, die für die LOC147645-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere VSIG10L-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom LOC147645 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom LOC147645 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des VSIG10L-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das LOC147645 HDR-Plasmid (h) und LOC147645 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von VSIG10L-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten VSIG10L-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.