JMJD3 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2): sc-401883-KO-2
- Zielspezies: human
- 20 µg transfektionsfertige, aufgereinigte Plasmid DNA; geeignet für 20 Transfektionen
- JMJD3 Das CRISPR/Cas9-Knockout (KO)-Plasmid (h2) ist ein Pool von Plasmiden, von denen jedes für die Cas9-Nuklease und eine zielspezifische 20-nt-Guide-RNA (gRNA) kodiert, die für maximale Knockout-Effizienz unter Verwendung von Sequenzen aus der GeCKO v2-Bibliothek entwickelt wurde
- gRNA-Sequenzen lenken Cas9 so, dass es ortsspezifische Doppelstrangbrüche (DSBs) im JMJD3-Genomlokus induziert, was zu einem Gen-Knockout durch nicht-homologe Endverknüpfung (NHEJ) führt
- Die Puromycin-Resistenz- und RFP-Gene werden von LoxP-Stellen flankiert, was die Entfernung der Selektionsmarker mittels Cre-Rekombinase (Cre-Vektor: sc-418923) nach der Etablierung stabiler Knockout-Zelllinien ermöglicht
Bestellinformation
| Produkt | Katalog # | EINHEIT | Preis | ANZAHL | Favoriten | |
JMJD3 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) | sc-401883-KO-2 | 20 µg | $397.00 |
Übersicht
KDM6B kodiert die Histon-Demethylase JMJD3, eine Fe(II)/2‑Oxoglutarat‑abhängige Dioxygenase, die repressive H3K27me3-Markierungen entfernt und dadurch die Transkriptionsaktivierung fördert. Durch epigenetisches Remodeling beeinflusst JMJD3 Entwicklungs-Geneprogramme, Zellschicksalsübergänge, Seneszenz sowie stimulusabhängige Transkription nachgeschaltet an Signalwegen wie NF‑κB und TGF‑β/SMAD. Seine Aktivität prägt die Chromatinzugänglichkeit an linien-/zelltypspezifischen Enhancern und Promotoren und trägt so zur Regulation von Entzündung und Differenzierung in zahlreichen Zelltypen bei. Eine Fehlregulation der KDM6B/JMJD3-Funktion wird mit der Epigenetik von Krebserkrankungen, der Biologie immunvermittelter Erkrankungen und weiteren Kontexten in Verbindung gebracht, in denen abweichende Chromatinzustände Genexpressionsnetzwerke verändern.
Das JMJD3 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des KDM6B-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des KDM6B-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.
Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von KDM6B nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die JMJD3-Proteinexpression aufheben.
Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von KDM6B-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der JMJD3-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.
Hauptmerkmale
- sgRNAs, die auf KDM6B-Exone abzielen, die für die JMJD3-Funktion entscheidend sind
Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
Pool von Plasmiden, die auf mehrere KDM6B-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion
Designvarianten
CRISPRs +/- HDRs
- gRNAs, die vom JMJD3 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom JMJD3 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des KDM6B-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das JMJD3 HDR-Plasmid (h) und JMJD3 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von KDM6B-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten KDM6B-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.