JMJD1A Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-403423

Descripción general

KDM3A codifica JMJD1A, una desmetilasa de histonas con dominio Jumonji C (JmjC) que elimina principalmente las marcas represivas H3K9me1/2 para promover la activación transcripcional. Al remodelar la accesibilidad de la cromatina, JMJD1A modula programas vinculados a la señalización de receptores hormonales, las respuestas a la hipoxia, la expresión génica metabólica y las decisiones sobre el destino celular. Su actividad se entrecruza con la regulación epigenética de los estados de potenciadores (enhancers) y promotores, influyendo en vías que gobiernan la proliferación, la diferenciación y la adaptación al estrés. La expresión o función desregulada de KDM3A/JMJD1A se ha asociado con redes transcripcionales alteradas observadas en múltiples contextos de cáncer y fenotipos metabólicos, lo que respalda la investigación de vulnerabilidades epigenéticas.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO JMJD1A (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen KDM3A en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del KDM3A junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de KDM3A tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína JMJD1A.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en KDM3A para la investigación de la señalización de JMJD1A, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de KDM3A críticos para la función de JMJD1A
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de KDM3A para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido JMJD1A CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido JMJD1A CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus KDM3A. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR JMJD1A (h) y el plásmido HDR JMJD1A (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología KDM3A para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana KDM3A definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.