HoxB5 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-409631

Panoramica

HOXB5 codifica per il fattore di trascrizione homeobox HoxB5, un regolatore del legame al DNA specifico per sequenza che contribuisce a stabilire il patterning antero-posteriore e l’identità tissutale durante lo sviluppo embrionale. HoxB5 partecipa a programmi trascrizionali a valle della segnalazione di morfogeni dello sviluppo, incluse le vie responsiva all’acido retinoico, per coordinare la specificazione di linea, la proliferazione e la differenziazione. In contesti adulti, un’espressione deregolata di HOXB5 è stata associata ad alterazioni del controllo dello stato cellulare e a reti trascrizionali aberranti osservate in molteplici dataset relativi a tumori e malattie ematopoietiche. In quanto regolatore nucleare, HoxB5 viene comunemente studiato per mappare circuiti di regolazione genica, la logica enhancer–promotore e i meccanismi di riprogrammazione dello sviluppo in modelli cellulari umani.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO HoxB5 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene HOXB5 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del HOXB5 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto HOXB5 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina HoxB5.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di HOXB5 per lo studio della segnalazione di HoxB5, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni HOXB5 critici per la funzione di HoxB5
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di HOXB5 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal HoxB5 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal HoxB5 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus HOXB5. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal HoxB5 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR HoxB5 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia HOXB5 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio HOXB5 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.