Plasmide CRISPR/Cas9 KO hnRNP UL1 (h): sc-405017

Présentation

HNRNPUL1 code la ribonucléoprotéine nucléaire hétérogène humaine UL1 (hnRNP UL1), un facteur associé à l’ARN et à l’ADN qui participe au traitement du pré-ARNm et à la coordination de l’expression génique avec le maintien du génome. hnRNP UL1 a été associée aux programmes de réponse aux dommages de l’ADN, notamment au recrutement et à la régulation de complexes liés à la réparation sur les sites de stress génotoxique, influençant ainsi la gestion du stress de réplication et la réparation couplée à la transcription. Par ces fonctions, HNRNPUL1 affecte la prolifération cellulaire et l’adaptation au stress en modulant le métabolisme de l’ARN et les processus de réparation associés à la chromatine. Une altération de la fonction ou de l’expression de hnRNP UL1 a été rapportée dans des contextes impliquant une instabilité génomique et un traitement de l’ARN dérégulé, ce qui étaye sa pertinence pour des études mécanistiques de voies associées aux maladies.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO hnRNP UL1 (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène HNRNPUL1 dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du HNRNPUL1, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert HNRNPUL1 à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine hnRNP UL1.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en HNRNPUL1 pour l'étude de la signalisation de hnRNP UL1, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de HNRNPUL1 essentiels à la fonction de hnRNP UL1
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de HNRNPUL1 pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le hnRNP UL1 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le hnRNP UL1 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus HNRNPUL1. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le hnRNP UL1 plasmide HDR (h) et le hnRNP UL1 (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie HNRNPUL1 pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles HNRNPUL1 définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.