hnRNP R CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-404489

Übersicht

HNRNPR kodiert das menschliche heterogene nukleäre Ribonukleoprotein R (hnRNP R), ein RNA-bindendes Protein, das mit neu entstehenden Transkripten und Ribonukleoproteinkomplexen assoziiert und die prä-mRNA-Prozessierung, die mRNA-Stabilität sowie die subzelluläre RNA-Lokalisierung reguliert. hnRNP R trägt zur posttranskriptionellen Genregulation bei, indem es über Interaktionen das alternative Spleißen und den RNA-Transport beeinflusst und so den nukleären RNA-Stoffwechsel mit der Kontrolle der zytoplasmatischen Translation verknüpft. Eine Fehlregulation von RNA-bindenden Proteinen und Spleiß-assoziierten Netzwerken wird mit Mechanismen neurodegenerativer und neuromuskulärer Erkrankungen in Verbindung gebracht, was HNRNPR zu einem hilfreichen Knotenpunkt für die Untersuchung der RNA-Homöostase macht. Experimentelle Untersuchungen von hnRNP R unterstützen Analysen auf Signalweg-Ebene zu Transkriptom-Remodellierung, stressabhängiger Dynamik von RNA-Granula und proteostasebezogenen Phänotypen.

Das hnRNP R CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des HNRNPR-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des HNRNPR-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von HNRNPR nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die hnRNP R-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von HNRNPR-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der hnRNP R-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf HNRNPR-Exone abzielen, die für die hnRNP R-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere HNRNPR-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom hnRNP R CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom hnRNP R CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des HNRNPR-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das hnRNP R HDR-Plasmid (h) und hnRNP R HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von HNRNPR-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten HNRNPR-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.