hnRNP A3 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h): sc-418346

Übersicht

HNRNPA3 kodiert das heterogene nukleäre Ribonukleoprotein A3 (hnRNP A3), ein RNA-bindendes Protein, das mit Prä‑mRNAs und reifen Transkripten assoziiert, um alternatives Spleißen, mRNA‑Stabilität und den nukleozytoplasmatischen Transport zu regulieren. hnRNP A3 ist an der Assemblierung von Ribonukleoproteinkomplexen beteiligt und hilft, Genexpressionsprogramme zu koordinieren, die mit RNA‑Prozessierung und Translation verknüpft sind. Eine Fehlregulation von Mitgliedern der hnRNP‑Familie wird häufig mit verändertem RNA‑Metabolismus, der Dynamik von Stressgranula und Proteostase‑Signalwegen in Verbindung gebracht. Diese Prozesse sind für die Krankheitsbiologie relevant, da aberrante posttranskriptionelle Regulation und aggregationsanfällige RNA‑bindende Proteine zu zellulärer Dysfunktion beitragen.

Das hnRNP A3 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) ist ein Pool von Plasmiden, die für die gezielte Disruption des HNRNPA3-Gens in human-Zelllinien entwickelt wurden. Jedes Plasmid koexprimiert eine einzigartige Single-Guide-RNA (sgRNA), die auf eine bestimmte Stelle innerhalb des HNRNPA3-Gens abzielt, zusammen mit der Streptococcus pyogenes Cas9-Nuklease. Die Plasmide kodieren zudem für GFP, was die fluoreszente Identifizierung und Anreicherung erfolgreich transfizierter Zellen mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie ermöglicht.

Das Multi-Guide-Design erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Insertionen oder Deletionen (Indels) entstehen, die den offenen Leserahmen von HNRNPA3 nach der Cas9-vermittelten Bildung von Doppelstrangbrüchen unterbrechen. Durch das CRISPR/Cas9-System verursachte DNA-Brüche werden über endogene NHEJ-Wege (Non-Homologous End Joining) repariert, was häufig zu Frameshift-Mutationen führt, die die hnRNP A3-Proteinexpression aufheben.

Dieses CRISPR-Knockout-System ermöglicht die effiziente Erzeugung von HNRNPA3-defizienten Zellmodellen zur Untersuchung der hnRNP A3-Signalübertragung, für funktionelle Genomstudien, in der Krebsbiologieforschung sowie zur Bewertung therapeutischer Reaktionen in menschlichen Zelllinien.

Hauptmerkmale

• sgRNAs, die auf HNRNPA3-Exone abzielen, die für die hnRNP A3-Funktion entscheidend sind
  Ko-Expression von SpCas9 und sgRNA aus einem einzigen Plasmid zur vereinfachten Verabreichung
  GFP-Reporter zur Identifizierung transfizierter Zellen
  Pool von Plasmiden, die auf mehrere HNRNPA3-Genomstellen abzielen, um die Knockout-Effizienz zu verbessern
  Kompatibel mit der Verabreichung durch Transfektion

Designvarianten

CRISPRs +/- HDRs

• gRNAs, die vom hnRNP A3 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h) und vom hnRNP A3 CRISPR/Cas9-KO-Plasmid (h2) kodiert werden, zielen auf unterschiedliche Stellen innerhalb des HNRNPA3-Lokus ab. Es kann ein oder beide Targeting-Designs verfügbar sein. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.
  HDR-Donorkonstrukte, kodiert durch das hnRNP A3 HDR-Plasmid (h) und hnRNP A3 HDR-Plasmid (h2) kodiert, enthalten eine Puromycin-Resistenzkassette und einen RFP-Reporter, flankiert von HNRNPA3-Homologiearmen, um die homologe Reparatur an definierten HNRNPA3-Zielstellen entsprechend den CRISPR/Cas9-KO-Designs zu unterstützen. Die Verfügbarkeit von HDR-Donoren kann variieren. Siehe „Verwandte Produkte“ für Verfügbarkeit.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.