GBDR1 Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-409781

Descripción general

UBAC1 (también reportado como GBDR1) codifica una proteína que contiene un dominio asociado a ubiquitina, implicada en el control de calidad de proteínas dependiente de ubiquitina y en la regulación del recambio proteico. Al reconocer sustratos ubiquitinados e interactuar con el sistema ubiquitina–proteasoma, UBAC1 está en posición de influir en vías que gobiernan la proteostasis, las respuestas al estrés y la dinámica de la señalización mediante la degradación controlada de componentes de las rutas. La desregulación de las redes de ubiquitinación se asocia ampliamente con señalización inflamatoria aberrante, alteraciones del control del ciclo celular y procesos neurodegenerativos y oncogénicos, lo que convierte a UBAC1/GBDR1 en un nodo relevante para estudios mecanísticos de la regulación mediada por ubiquitina. Investigar la función de UBAC1 puede ayudar a aclarar cómo el reconocimiento y el tráfico de ubiquitina contribuyen a la robustez de las vías en condiciones basales y de estrés.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO GBDR1 (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen UBAC1 en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del UBAC1 junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de UBAC1 tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína GBDR1.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en UBAC1 para la investigación de la señalización de GBDR1, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de UBAC1 críticos para la función de GBDR1
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de UBAC1 para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido GBDR1 CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido GBDR1 CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus UBAC1. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR GBDR1 (h) y el plásmido HDR GBDR1 (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología UBAC1 para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana UBAC1 definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.