Plasmide CRISPR/Cas9 KO EDG-3 (h): sc-401366

Présentation

S1PR3 (EDG-3) code un récepteur couplé aux protéines G de la sphingosine-1-phosphate, qui s’associe à Gαi, Gαq et Gα12/13 pour réguler la mobilisation du calcium, la signalisation MAPK/ERK, l’activation des GTPases de la famille Rho et le remodelage du cytosquelette. Par ces voies, EDG-3 influence la fonction de barrière endothéliale, le tonus vasculaire, le trafic des leucocytes et la migration cellulaire, en intégrant des signaux lipidiques extracellulaires aux programmes de signalisation d’adhérence et d’inflammation. Une activité altérée de S1PR3 a été associée à une inflammation dérégulée et au remodelage vasculaire, et est fréquemment étudiée dans des contextes tels que l’athérosclérose, la fibrose et les interactions tumeur–microenvironnement. Ces caractéristiques font de S1PR3 une cible utile pour disséquer les réseaux de signalisation des sphingolipides en immunologie et en biologie vasculaire.

Le plasmide CRISPR/Cas9 KO EDG-3 (h) est un ensemble de plasmides conçus pour la disruption ciblée du gène S1PR3 dans les lignées cellulaires human. Chaque plasmide co-exprime un ARN guide unique (sgRNA) ciblant un site distinct au sein du S1PR3, ainsi que la nucléase Cas9 de Streptococcus pyogenes. Les plasmides codent également pour la GFP, ce qui permet l'identification par fluorescence et l'enrichissement des cellules transfectées avec succès par microscopie à fluorescence ou cytométrie en flux.

La conception multi-guide augmente la probabilité de générer des insertions ou des délétions (indels) qui perturbent le cadre de lecture ouvert S1PR3 à la suite de la formation de cassures double brin médiées par Cas9. Les cassures d'ADN introduites par le système CRISPR/Cas9 sont réparées par des voies endogènes de jonction non homologue (NHEJ), ce qui entraîne fréquemment des mutations par décalage du cadre de lecture qui suppriment l'expression de la protéine EDG-3.

Ce système de knock-out CRISPR permet la génération efficace de modèles cellulaires déficients en S1PR3 pour l'étude de la signalisation de EDG-3, les études de génomique fonctionnelle, la recherche en biologie du cancer et l'évaluation des réponses thérapeutiques dans des lignées cellulaires humaines.

Caractéristiques principales

• sgRNA ciblant le ou les exons de S1PR3 essentiels à la fonction de EDG-3
  Co-expression de SpCas9 et de sgRNA à partir d'un seul plasmide pour une administration simplifiée
  Rapporteur GFP pour l'identification des cellules transfectées
  Pool de plasmides ciblant plusieurs sites génomiques de S1PR3 pour améliorer l'efficacité du knock-out
  Compatible avec l'administration par transfection

Variantes de conception

CRISPR +/- HDR

• Les gRNA codés par le EDG-3 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h) et le EDG-3 plasmide CRISPR/Cas9 KO (h2) ciblent des sites distincts au sein du locus S1PR3. Une ou les deux conceptions de ciblage peuvent être disponibles. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.
  Les constructions donneuses HDR codées par le EDG-3 plasmide HDR (h) et le EDG-3 (h2) contiennent une cassette de résistance à la puromycine et un rapporteur RFP flanqué de bras d'homologie S1PR3 pour permettre la réparation dirigée par homologie au niveau de sites cibles S1PR3 définis correspondant aux conceptions CRISPR/Cas9 KO. La disponibilité des donneurs HDR peut varier. Voir les produits associés pour connaître la disponibilité.

Réservé à la recherche. N'est pas destiné à un usage diagnostique ou thérapeutique.