Caper Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO (h): sc-416921

Visão geral

RBM39 codifica a proteína humana de ligação a RNA Caper, um fator nuclear de splicing que acopla a transcrição ao processamento do pré-mRNA por meio de interações com componentes do spliceossomo e correpressores/coativadores transcricionais. A Caper contribui para decisões de splicing alternativo e para programas de metabolismo de RNA que moldam a progressão do ciclo celular, a diferenciação e a expressão gênica responsiva ao estresse. A atividade desregulada de RBM39 e padrões aberrantes de splicing têm sido associados a saídas de sinalização oncogênica e a uma composição alterada do proteoma em múltiplos contextos tumorais. Como resultado, RBM39 é frequentemente estudado para conectar a função do spliceossomo ao redirecionamento de vias e a mecanismos mediados por RNA de fenótipos relevantes para doenças.

O Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO Caper (h) é um conjunto de plasmídeos concebido para a interrupção direcionada do gene RBM39 em linhas celulares human. Cada plasmídeo coexpressa um RNA guia único (sgRNA) direcionado a um local distinto dentro do RBM39, juntamente com a nuclease Cas9 de Streptococcus pyogenes. Os plasmídeos também codificam GFP, permitindo a identificação fluorescente e o enriquecimento de células transfectadas com sucesso por microscopia de fluorescência ou citometria de fluxo.

O design multiguia aumenta a probabilidade de gerar inserções ou deleções (indels) que interrompem o quadro de leitura aberto do RBM39 na sequência da formação de quebras de cadeia dupla mediadas por Cas9. As quebras de ADN introduzidas pelo sistema CRISPR/Cas9 são reparadas através de vias endógenas de junção de extremidades não homólogas (NHEJ), resultando frequentemente em mutações de deslocamento de quadro que abolir a expressão da proteína Caper.

Este sistema de knockout CRISPR permite a geração eficiente de modelos celulares com deficiência de RBM39 para a investigação da sinalização de Caper, estudos de genómica funcional, investigação em biologia do cancro e avaliação de respostas terapêuticas em linhas celulares humanas.

Características principais

• sgRNAs direcionados para o(s) exão(ões) RBM39 críticos para a função Caper
  Coexpressão de SpCas9 e sgRNA a partir de um único plasmídeo para simplificar a administração
  Repórter GFP para identificação de células transfectadas
  Conjunto de plasmídeos direcionados para múltiplos locais genómicos RBM39 para melhorar a eficiência do knockout
  Compatível com administração por transfecção

Variantes de Design

CRISPRs +/- HDRs

• Os gRNAs codificados pelo Caper Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO (h) e pelo Caper Plasmídeo CRISPR/Cas9 KO (h2) têm como alvo locais distintos dentro do locus RBM39. Pode estar disponível um ou ambos os designs de alvo. Consulte Produtos Relacionados para verificar a disponibilidade.
  As construções doadoras HDR codificadas pelo Caper Plasmídeo HDR (h) e o Plasmídeo HDR Caper (h2) contêm uma cassete de resistência à puromicina e um repórter RFP flanqueado por braços de homologia RBM39 para suportar a reparação dirigida por homologia em locais-alvo RBM39 definidos, correspondentes aos desenhos de KO CRISPR/Cas9. A disponibilidade do doador HDR pode variar. Consulte Produtos Relacionados para verificar a disponibilidade.

Apenas para uso em investigação. Não se destina a uso diagnóstico ou terapêutico.