BAF53B Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-409940

Descripción general

ACTL6B codifica BAF53B, una subunidad proteica relacionada con la actina de los complejos de remodelación de cromatina dependientes de ATP SWI/SNF (BAF), enriquecidos en neuronas, que regulan el posicionamiento de los nucleosomas y la accesibilidad de la cromatina. BAF53B sostiene programas transcripcionales necesarios para la diferenciación neuronal, la maduración dendrítica y sináptica, y la regulación génica dependiente de la actividad, coordinándose con otros componentes BAF para modular el uso de potenciadores y promotores. A través de estas funciones epigenéticas, ACTL6B se vincula con vías que controlan la temporización del neurodesarrollo, la conectividad neuronal y la plasticidad. Alteraciones genéticas y funcionales de ACTL6B/BAF53B se han asociado con trastornos del neurodesarrollo y con estados alterados de expresión génica neuronal relevantes para modelos de fenotipos cognitivos y conductuales.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO BAF53B (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción dirigida del gen ACTL6B en líneas celulares human. Cada plásmido coexpresa un ARN guía único (sgRNA) dirigido a un sitio distinto dentro del ACTL6B junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes. Los plásmidos también codifican GFP, lo que permite la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito mediante microscopía de fluorescencia o citometría de flujo.

El diseño multiguía aumenta la probabilidad de generar inserciones o deleciones (indeles) que interrumpan el marco de lectura abierto de ACTL6B tras la formación de roturas de doble cadena mediadas por Cas9. Las roturas de ADN introducidas por el sistema CRISPR/Cas9 se reparan a través de vías endógenas de unión de extremos no homólogos (NHEJ), lo que con frecuencia da lugar a mutaciones de desplazamiento del marco de lectura que anulan la expresión de la proteína BAF53B.

Este sistema de knockout CRISPR permite la generación eficiente de modelos celulares deficientes en ACTL6B para la investigación de la señalización de BAF53B, estudios de genómica funcional, investigación en biología del cáncer y evaluación de respuestas terapéuticas en líneas celulares humanas.

Características principales

• sgRNA dirigidos a los exones de ACTL6B críticos para la función de BAF53B
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para simplificar la administración
  Reportero GFP para la identificación de células transfectadas
  Conjunto de plásmidos dirigidos a múltiples sitios genómicos de ACTL6B para mejorar la eficiencia del knockout
  Compatible con la administración mediante transfección

Variantes de diseño

CRISPRs +/- HDRs

• Los gRNA codificados por el plásmido BAF53B CRISPR/Cas9 KO (h) y el plásmido BAF53B CRISPR/Cas9 KO (h2) se dirigen a sitios distintos dentro del locus ACTL6B. Puede estar disponible uno o ambos diseños de orientación. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.
  Las construcciones donantes HDR codificadas por el plásmido HDR BAF53B (h) y el plásmido HDR BAF53B (h2) contienen un casete de resistencia a la puromicina y un reportero RFP flanqueado por brazos de homología ACTL6B para facilitar la reparación dirigida por homología en sitios diana ACTL6B definidos que se corresponden con los diseños de KO de CRISPR/Cas9. La disponibilidad de los donantes HDR puede variar. Consulte «Productos relacionados» para conocer la disponibilidad.

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.