ARHGAP11B Plásmido CRISPR/Cas9 KO (h): sc-416795

Descripción general

ARHGAP11B codifica un factor relacionado con proteínas activadoras de GTPasa Rho específico de humanos, que se expresa en niveles altos en poblaciones de progenitores neurales y se ha implicado en la regulación de la dinámica del citoesqueleto, la polaridad celular y el comportamiento proliferativo durante la corticogénesis. Aunque deriva de la familia ARHGAP11, se ha descrito que ARHGAP11B presenta una actividad RhoGAP atípica o alterada, lo que la vincula con la modulación de las salidas de señalización de la familia Rho, que convergen con la remodelación de actina y los procesos mitóticos. Su actividad se ha asociado con la expansión de progenitores tipo glía radial basal y con cambios en programas de linaje neuronal, lo que la hace relevante para estudios del desarrollo del cerebro humano y la neurobiología evolutiva. La expresión desregulada o las alteraciones de vías que involucren a ARHGAP11B son de interés en modelos celulares de fenotipos del neurodesarrollo y en contextos en los que estados tipo progenitor y la remodelación del citoesqueleto contribuyen a la biología de la enfermedad.

El plásmido CRISPR/Cas9 KO ARHGAP11B (h) es un conjunto de plásmidos diseñado para la interrupción selectiva del gen ARHGAP11B en líneas celulares human. Cada plásmido del conjunto coexpresa un ARN guía específico (sgRNA) único, dirigido a un sitio distinto dentro del locus ARHGAP11B, junto con la nucleasa Cas9 de Streptococcus pyogenes, y codifica GFP para permitir la identificación fluorescente y el enriquecimiento de las células transfectadas con éxito. Esta estrategia multiguía aumenta la probabilidad de inducir desplazamientos de marco de lectura o deleciones que produzcan una inactivación funcional, ofreciendo una alternativa más robusta a los enfoques de guía única. Las DSB inducidas en múltiples sitios se resuelven mediante unión de extremos no homólogos (NHEJ) o, cuando se utiliza con la plantilla donante HDR incluida, mediante reparación dirigida por homología (HDR) en un sitio diana definido dentro del locus.

Cuando se utiliza junto con el donante HDR que expresa RFP, la fluorescencia de GFP y RFP puede utilizarse conjuntamente para distinguir las poblaciones de células transfectadas de las editadas, lo que agiliza los flujos de trabajo de clasificación y selección de clones basados en citometría de flujo.

Donante de reparación dirigida por homología (HDR) — Casete de puromicina con reportero RFP

Para aplicaciones que requieren clones knockout confirmados y seleccionables, el plásmido HDR ARHGAP11B (h) incluye un constructo donante HDR que contiene un casete de resistencia a la puromicina (PuroR) y un reportero de proteína fluorescente roja (RFP), flanqueado por brazos de homología específicos de un sitio diana definido ARHGAP11B.
Cuando se cotransfecciona con el plásmido ARHGAP11B CRISPR/Cas9 KO (h):

• El casete PuroR-RFP se integra en el sitio de corte de Cas9 mediante HDR, interrumpiendo el marco de lectura abierto ARHGAP11B.
  La fluorescencia de la RFP proporciona un indicador visual inmediato del éxito de la integración, lo que permite la identificación o clasificación basada en la fluorescencia de las células editadas antes o junto con la selección con puromicina.
  Las células editadas con éxito se confirman mediante la resistencia a la puromicina, lo que reduce sustancialmente la carga de cribado de clones.
  Esta estrategia de selección es ideal para generar líneas celulares KO clonales estables para estudios funcionales posteriores, cribado de fármacos o desarrollo de modelos.

Sistema de eliminación del casete Cre-lox

La construcción donante HDR cuenta con sitios loxP que flanquean el casete de selección PuroR-RFP para permitir la eliminación limpia del marcador tras la confirmación del clon. La expresión transitoria de la recombinasa Cre a través del vector Cre: sc-418923 incluido extirpa el casete, dejando un sitio loxP residual mínimo dentro del locus ARHGAP11B y eliminando posibles efectos de confusión en los ensayos posteriores.
Este enfoque en dos pasos:

• Minimiza la alteración de la arquitectura local de la cromatina y de los elementos reguladores vecinos
  Restaura un contexto genómico casi nativo en el locus editado
  Permite reutilizar la estrategia de selección con puromicina en la misma línea celular para ediciones adicionales

Características principales

• gRNA dirigido a los exones ARHGAP11B críticos para la función ARHGAP11B
  Coexpresión de SpCas9 y sgRNA a partir de un único plásmido para una administración simplificada
  Donante HDR con resistencia a la puromicina para la selección positiva de clones
  Casete PuroR flanqueado por loxP con vector de recombinasa Cre para la eliminación sin fisuras del marcador
  Se suministra listo para su uso mediante transfección

Sólo para uso en investigación. No destinado a uso diagnóstico o terapéutico.